166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1126 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
292 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  35.22 
 
 
452 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  44.14 
 
 
535 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  38.53 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  44.66 
 
 
113 aa  95.5  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  30.77 
 
 
298 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  72.86 
 
 
2397 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  39.5 
 
 
948 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
450 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  42.16 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  38.28 
 
 
478 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
175 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  37.61 
 
 
495 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  40.74 
 
 
483 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 
426 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  61.43 
 
 
2449 aa  87  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  43.24 
 
 
591 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  37.82 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.61 
 
 
907 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.2 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  36 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  36.61 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
418 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  38.74 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
456 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 
1176 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  32.67 
 
 
521 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  36.89 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  36.75 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  35.59 
 
 
182 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  35.04 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  37.27 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  33.33 
 
 
763 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  36.89 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  36.89 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  33.93 
 
 
718 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  34.69 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  36.61 
 
 
732 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  33.66 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  37.08 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  32.26 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.09 
 
 
657 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  32.14 
 
 
763 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  36 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  36.94 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  35.09 
 
 
758 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  26.09 
 
 
1305 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  30.89 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  31.53 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  32.76 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  30.91 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  26.74 
 
 
950 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  32.54 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  29.7 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  47.95 
 
 
1977 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.86 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  34.04 
 
 
553 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  59.17 
 
 
848 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  45.24 
 
 
1049 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  25.86 
 
 
549 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  34.82 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
704 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  30.36 
 
 
781 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  31.37 
 
 
176 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  31.37 
 
 
414 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  33.62 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
792 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  28.16 
 
 
474 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 
574 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 
431 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  31.94 
 
 
421 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  27.93 
 
 
741 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  44.94 
 
 
653 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 
784 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  27.73 
 
 
751 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
650 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  22.56 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  33.33 
 
 
372 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 
429 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  29.5 
 
 
502 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  36.04 
 
 
332 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  34.43 
 
 
446 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  27.68 
 
 
625 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  62.39 
 
 
623 aa  58.9  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.79 
 
 
657 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  29.19 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  29.91 
 
 
784 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  29.79 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  34.83 
 
 
606 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  32.67 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0480  copper amine oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000283762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1234  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.23 
 
 
437 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>