More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1118 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  807    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  65.17 
 
 
415 aa  564  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  51.91 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  52.42 
 
 
397 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  44.35 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
439 aa  322  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  34.1 
 
 
411 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  34.97 
 
 
485 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
407 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  31.11 
 
 
425 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
412 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  33.25 
 
 
405 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
439 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.75 
 
 
394 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 
411 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  29.58 
 
 
422 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  28.68 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  29.32 
 
 
422 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.05 
 
 
1816 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  28.04 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  28.65 
 
 
450 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  26.6 
 
 
425 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.69 
 
 
422 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  28.95 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  28.15 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  24.42 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  28.15 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  27.88 
 
 
422 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  27.88 
 
 
422 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  27.18 
 
 
425 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.61 
 
 
422 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  28.15 
 
 
422 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  26.27 
 
 
1769 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.95 
 
 
1833 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.92 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.49 
 
 
390 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.49 
 
 
390 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.38 
 
 
413 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.38 
 
 
413 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  28.8 
 
 
434 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  27.65 
 
 
423 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.66 
 
 
414 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.34 
 
 
418 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.87 
 
 
1876 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.32 
 
 
2720 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.12 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.46 
 
 
1829 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.38 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.85 
 
 
441 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.03 
 
 
424 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.79 
 
 
1864 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.56 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
433 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  28.73 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.89 
 
 
1806 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  25.82 
 
 
445 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  26.6 
 
 
449 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.31 
 
 
474 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  26.44 
 
 
414 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
499 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 
415 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
414 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 
423 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.54 
 
 
1776 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
432 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
432 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
438 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  25.06 
 
 
495 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.72 
 
 
414 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
409 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 
415 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  25.72 
 
 
417 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  26.33 
 
 
449 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
433 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.24 
 
 
417 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.24 
 
 
415 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.24 
 
 
417 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
421 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
442 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  25.65 
 
 
434 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.41 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  25.65 
 
 
434 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.93 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  24.64 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.3 
 
 
1839 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.12 
 
 
427 aa  96.7  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.37 
 
 
446 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.81 
 
 
431 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  24.94 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>