143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1099 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
475 aa  986    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  51.95 
 
 
469 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 
814 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  31.04 
 
 
502 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  35.47 
 
 
516 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 
621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  31.84 
 
 
681 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  29.65 
 
 
451 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.13 
 
 
578 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  28.22 
 
 
743 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  29.51 
 
 
593 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  30.58 
 
 
545 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  27.9 
 
 
572 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  26.86 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  27.09 
 
 
589 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  28.22 
 
 
572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.3 
 
 
900 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.54 
 
 
335 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  28.01 
 
 
566 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
343 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 
335 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  24.61 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 
312 aa  94.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  52.5 
 
 
295 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  56.92 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  50.7 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  55.88 
 
 
436 aa  77  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.1 
 
 
673 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.31 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  53.62 
 
 
725 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  39.05 
 
 
861 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  23.95 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  36.14 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50.72 
 
 
873 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  43.96 
 
 
949 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  44.78 
 
 
298 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  41.33 
 
 
922 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  45.57 
 
 
532 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.1 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.47 
 
 
780 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
332 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  30.26 
 
 
955 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 
895 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  39.24 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  46.88 
 
 
885 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  49.21 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  42.35 
 
 
646 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  45.33 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  46.15 
 
 
737 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  39.81 
 
 
686 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  45.45 
 
 
715 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
649 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  40.3 
 
 
477 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  44.78 
 
 
435 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  54.55 
 
 
757 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 
1051 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 
536 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  39.34 
 
 
746 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  22.71 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 
742 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  41.54 
 
 
732 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  42.47 
 
 
552 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  39.44 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
590 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  51.79 
 
 
874 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 
961 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 
1224 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  43.08 
 
 
730 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 
566 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  40.3 
 
 
524 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  46.88 
 
 
308 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
604 aa  53.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  39.74 
 
 
630 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 
741 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  38.96 
 
 
577 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
541 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 
1122 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  35.29 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.11 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.39 
 
 
567 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  41.94 
 
 
583 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  37.31 
 
 
621 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  37.68 
 
 
311 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 
611 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  34.94 
 
 
848 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 
710 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.56 
 
 
365 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.73 
 
 
790 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
580 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 
928 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.71 
 
 
469 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
1601 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  37.31 
 
 
679 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 
683 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  38.46 
 
 
533 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
639 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  39.71 
 
 
591 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  43.75 
 
 
722 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>