More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1079 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 
187 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
213 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
200 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
216 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
216 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
216 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 
212 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
227 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
201 aa  89  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
201 aa  87  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
193 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
188 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  27.62 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30.65 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 
264 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
233 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.52 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  28.49 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  28.43 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  28.8 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  26.73 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  28.04 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.43 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  25 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.29 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  25.39 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  29 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  29 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.67 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  25.96 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  29.19 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  25.96 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  28.5 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  28.5 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.42 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  25.48 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  27.41 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  29 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  25.48 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  28.28 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  25.48 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  28.1 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  31.84 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>