More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1022 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
479 aa  937    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  58.25 
 
 
491 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  57.77 
 
 
495 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  58.49 
 
 
495 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  57.77 
 
 
495 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  52.24 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  52.24 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  51.06 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  50.11 
 
 
463 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  50.11 
 
 
463 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  45.83 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  45.83 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  46.25 
 
 
466 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  42.56 
 
 
458 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  34.91 
 
 
458 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  34.91 
 
 
458 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  29.38 
 
 
516 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 
522 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
480 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  29.04 
 
 
516 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  28.99 
 
 
514 aa  143  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
478 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.05 
 
 
457 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
484 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  29.13 
 
 
514 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
478 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.75 
 
 
498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
457 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  26.89 
 
 
534 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.63 
 
 
469 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
458 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  28.06 
 
 
512 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 
493 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  27.51 
 
 
512 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 
516 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  27.15 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  26.68 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  28.61 
 
 
519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
574 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  26.68 
 
 
512 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  26.68 
 
 
512 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
509 aa  119  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  29 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 
521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
488 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
474 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.2 
 
 
482 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
539 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.42 
 
 
541 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
522 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.95 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  27.16 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  26.92 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
465 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  26.21 
 
 
500 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 
471 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  27.83 
 
 
515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 
504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 
515 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  24.94 
 
 
452 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
480 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 
528 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  25.61 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.09 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5461  major facilitator transporter  26.57 
 
 
403 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
520 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5860  major facilitator transporter  26.57 
 
 
403 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336135  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
524 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  27.83 
 
 
470 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  26.17 
 
 
511 aa  110  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 
488 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  29.46 
 
 
508 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 
534 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
517 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1434  MFS family transporter  24.7 
 
 
452 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
500 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
573 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>