200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1004 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 791 aa  1653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  35.63 
 
 		 783 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  41.67 
 
 		 969 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.39 
 
 		 973 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  42.05 
 
 		 951 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  39.63 
 
 		 944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 995 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  31.03 
 
 		 806 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3277  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 		 974 aa  361  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  32.48 
 
 		 679 aa  317  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.64 
 
 		 770 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  28.69 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  31.57 
 
 		 679 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  31.23 
 
 		 679 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  31.4 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  30.89 
 
 		 679 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  30.89 
 
 		 679 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02870  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  27.83 
 
 		 690 aa  290  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  31.23 
 
 		 695 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  29.73 
 
 		 668 aa  283  9e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.85 
 
 		 777 aa  279  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.39 
 
 		 1024 aa  274  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 699 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.845548 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.56 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  30.15 
 
 		 801 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  30.27 
 
 		 840 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  26.75 
 
 		 779 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  30.39 
 
 		 779 aa  251  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.11 
 
 		 752 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  26.88 
 
 		 803 aa  243  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  30.31 
 
 		 779 aa  241  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  25.97 
 
 		 828 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 792 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  28.55 
 
 		 821 aa  232  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.15 
 
 		 821 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  28.03 
 
 		 839 aa  231  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.79 
 
 		 836 aa  230  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  25.92 
 
 		 799 aa  230  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  28.3 
 
 		 760 aa  228  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  27.26 
 
 		 765 aa  227  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.71 
 
 		 746 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  26.21 
 
 		 765 aa  221  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 806 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.56 
 
 		 845 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  28.74 
 
 		 794 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  27.62 
 
 		 797 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  25.24 
 
 		 836 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  25.88 
 
 		 795 aa  204  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  28.39 
 
 		 757 aa  203  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  26.38 
 
 		 768 aa  203  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 799 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 743 aa  197  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 695 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  28.14 
 
 		 799 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 927 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  24.6 
 
 		 825 aa  190  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.67 
 
 		 788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.31 
 
 		 787 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  27.71 
 
 		 794 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 795 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  25.22 
 
 		 795 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  24.33 
 
 		 798 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  27.5 
 
 		 762 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  26.72 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  26.71 
 
 		 798 aa  181  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  27.17 
 
 		 661 aa  181  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  25.55 
 
 		 752 aa  177  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  23.52 
 
 		 828 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  27.77 
 
 		 656 aa  177  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  24.72 
 
 		 791 aa  174  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  26.58 
 
 		 829 aa  172  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  25.73 
 
 		 687 aa  172  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.27 
 
 		 788 aa  170  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.91 
 
 		 788 aa  170  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 845 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  27.17 
 
 		 790 aa  169  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  25.12 
 
 		 816 aa  168  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 797 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.72 
 
 		 803 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  25.54 
 
 		 702 aa  165  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  26.98 
 
 		 803 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  24.03 
 
 		 806 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  27.16 
 
 		 803 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  25.58 
 
 		 821 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 		 806 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  25.47 
 
 		 1016 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  22.38 
 
 		 772 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  24.75 
 
 		 728 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 806 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 806 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  23.68 
 
 		 1207 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  26.02 
 
 		 685 aa  160  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  23.56 
 
 		 816 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  22.5 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  22.5 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  22.5 
 
 		 772 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  22.5 
 
 		 772 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>