More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0993 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 
2286 aa  4661  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  32.38 
 
 
965 aa  386  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  31.42 
 
 
951 aa  386  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.89 
 
 
631 aa  293  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.97 
 
 
6885 aa  235  8e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.36 
 
 
547 aa  214  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.21 
 
 
2073 aa  214  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  48.98 
 
 
1050 aa  174  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  45.6 
 
 
1020 aa  162  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  31.53 
 
 
1457 aa  159  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  45.08 
 
 
1059 aa  157  3e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  44.56 
 
 
1059 aa  156  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  41.25 
 
 
1495 aa  155  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  41.29 
 
 
1041 aa  149  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  29.43 
 
 
3320 aa  146  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  32.59 
 
 
609 aa  145  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  24.26 
 
 
722 aa  141  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  40 
 
 
930 aa  135  1e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  23.9 
 
 
839 aa  134  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  28.61 
 
 
756 aa  130  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  27.93 
 
 
1729 aa  127  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  6.07429e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  35.15 
 
 
215 aa  123  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  27.87 
 
 
2207 aa  121  1e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  25.79 
 
 
801 aa  122  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  38.55 
 
 
1042 aa  120  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  36.14 
 
 
1018 aa  120  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  31.61 
 
 
680 aa  119  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  33.53 
 
 
729 aa  118  1e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  23.04 
 
 
1847 aa  117  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.23 
 
 
1661 aa  117  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  23 
 
 
832 aa  117  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  47.44 
 
 
548 aa  111  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  27.57 
 
 
573 aa  108  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  26.02 
 
 
1260 aa  107  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  30.41 
 
 
1174 aa  106  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.78 
 
 
743 aa  106  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  22.27 
 
 
838 aa  106  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
459 aa  105  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.39148e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  34.25 
 
 
1887 aa  104  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  27.21 
 
 
2375 aa  104  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  33.87 
 
 
779 aa  103  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  30.64 
 
 
456 aa  103  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.04 
 
 
455 aa  102  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  31.1 
 
 
932 aa  102  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.82 
 
 
455 aa  100  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  31.63 
 
 
1037 aa  100  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  8.95355e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.8 
 
 
455 aa  99.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.8 
 
 
455 aa  99.8  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.82 
 
 
455 aa  99.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  27.78 
 
 
618 aa  98.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.82 
 
 
455 aa  98.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.78 
 
 
455 aa  97.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  32.97 
 
 
691 aa  97.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  32.97 
 
 
506 aa  97.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.41 
 
 
1029 aa  97.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  33.33 
 
 
455 aa  97.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.33 
 
 
455 aa  97.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.3 
 
 
455 aa  97.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
458 aa  97.1  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.17 
 
 
456 aa  95.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
1016 aa  95.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  34.27 
 
 
1013 aa  95.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.28 
 
 
1009 aa  95.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.69 
 
 
809 aa  94  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  21.23 
 
 
627 aa  94.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.63 
 
 
2170 aa  93.2  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  23.15 
 
 
1011 aa  93.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  23.37 
 
 
580 aa  92.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  35.29 
 
 
1019 aa  92  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.44 
 
 
1226 aa  92  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  27.13 
 
 
1049 aa  90.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.85 
 
 
455 aa  90.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32.21 
 
 
1168 aa  90.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  34.88 
 
 
997 aa  89.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  32.18 
 
 
1081 aa  89  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.16 
 
 
693 aa  88.6  1e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  31.75 
 
 
1748 aa  89  1e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  30.35 
 
 
935 aa  88.2  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.34 
 
 
458 aa  87.4  3e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.11699e-09 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  29.69 
 
 
548 aa  87  4e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  27.19 
 
 
457 aa  86.7  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.73 
 
 
729 aa  86.7  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  33.01 
 
 
1215 aa  86.3  6e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.1 
 
 
995 aa  86.3  6e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  34.39 
 
 
768 aa  86.3  7e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  30.27 
 
 
733 aa  85.5  1e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30.51 
 
 
1275 aa  84.3  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  32.29 
 
 
1160 aa  84.3  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  6.00941e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.73 
 
 
1146 aa  82.8  7e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.52 
 
 
1331 aa  82.8  8e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.99 
 
 
973 aa  82.4  9e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.76 
 
 
926 aa  82.4  9e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  25.56 
 
 
524 aa  82  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  32.4 
 
 
594 aa  82  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.47431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.28 
 
 
1054 aa  81.3  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  30.59 
 
 
535 aa  81.3  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.76 
 
 
1221 aa  80.5  3e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  29.71 
 
 
531 aa  80.1  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.43 
 
 
1916 aa  80.1  5e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.31 
 
 
803 aa  79.7  6e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>