More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0950 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  100 
 
 		 435 aa  886    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.18 
 
 		 472 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 464 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  33.64 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  38.61 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  36.73 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  34.74 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  33.26 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  32.24 
 
 		 454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.88 
 
 		 459 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  36.01 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.67 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  33.03 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  31.29 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  32.37 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  32.9 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  27.71 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  31.03 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.9 
 
 		 624 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  27.33 
 
 		 600 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.11 
 
 		 600 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  28.31 
 
 		 672 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.1 
 
 		 641 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  28.71 
 
 		 440 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.65 
 
 		 606 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  30.12 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  27.59 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  28.18 
 
 		 761 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  27.23 
 
 		 758 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  31.11 
 
 		 421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.35 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.19 
 
 		 618 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.7 
 
 		 722 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  28.47 
 
 		 797 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  28.32 
 
 		 748 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26 
 
 		 764 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.16 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  28.71 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  27.17 
 
 		 763 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  23.52 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  24.75 
 
 		 680 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  26.75 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.68 
 
 		 582 aa  79.7  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.78 
 
 		 584 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.78 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  25.6 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.58 
 
 		 599 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.84 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  27.54 
 
 		 696 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.08 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  23.86 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  33.02 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  28.76 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  29.66 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.45 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.33 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  30.19 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.95 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  30.3 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  60.87 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  40.62 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.52 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.06 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  54.35 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 537 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28.28 
 
 		 531 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.17 
 
 		 466 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.19 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 		 468 aa  53.9  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  27.27 
 
 		 527 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  26.62 
 
 		 568 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>