More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0944 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 539 aa  1098    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 529 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  29.09 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 546 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 519 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 525 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  22.82 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  23.59 
 
 		 542 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 548 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  23.43 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  23.16 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 566 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 537 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  21.8 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 543 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 544 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  22.85 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 414 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  22.55 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 538 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 258 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 365 aa  106  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  21.27 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  34.53 
 
 		 265 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 532 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 519 aa  94  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 405 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 222 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 259 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 252 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 223 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  27.04 
 
 		 252 aa  87  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 348 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  27.04 
 
 		 252 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  35.4 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  34.75 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  24.15 
 
 		 760 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 219 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 224 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  37.4 
 
 		 207 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 207 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  37.93 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  35.2 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  35.2 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 526 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  35.83 
 
 		 206 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 473 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 273 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>