122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0943 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 457 aa  946    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.35 
 
 		 472 aa  345  8.999999999999999e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  39.64 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  36.78 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  37.53 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.63 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  32.11 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  32.37 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  34.58 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 453 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  32.13 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  33.62 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  31.97 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.84 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  33.03 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.03 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  29.55 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  29.42 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  30.61 
 
 		 672 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 455 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  28.24 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  28.24 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  28.69 
 
 		 606 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  29.25 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.52 
 
 		 600 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  28.95 
 
 		 624 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  29.6 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  27.77 
 
 		 618 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  29.49 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.6 
 
 		 641 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  26.62 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  23.6 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  26.8 
 
 		 764 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.54 
 
 		 748 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  25.51 
 
 		 757 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  23.26 
 
 		 758 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.11 
 
 		 600 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  24.01 
 
 		 761 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  24.56 
 
 		 797 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  25.43 
 
 		 764 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  23.72 
 
 		 625 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  23.33 
 
 		 619 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  30.77 
 
 		 763 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  33.54 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  34.51 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  22.75 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.4 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  22.5 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.2 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  26.79 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  28.4 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  36.11 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  28.38 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  28.38 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  29.08 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  44.59 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  28.17 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  44.59 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  27.74 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  30.65 
 
 		 549 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  27.03 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  29.05 
 
 		 668 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 538 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  26.05 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  27.82 
 
 		 514 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  31.67 
 
 		 660 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  26.15 
 
 		 527 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  28.1 
 
 		 531 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.03 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  38.66 
 
 		 675 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  23.29 
 
 		 595 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.92 
 
 		 561 aa  50.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  20.9 
 
 		 568 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  32.17 
 
 		 679 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>