40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0906 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0906  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  702  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.36327e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0786  hypothetical protein  54.6 
 
 
355 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1799  uncharacterized Fe-S center protein, putative ferredoxin  55.36 
 
 
335 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.160059  hitchhiker  0.00269064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17170  uncharacterized Fe-S center protein  41.02 
 
 
378 aa  215  1e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0995  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.61 
 
 
366 aa  141  2e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0593  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.7 
 
 
445 aa  137  3e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.07 
 
 
377 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.12 
 
 
377 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.21 
 
 
368 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.69 
 
 
357 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.33582e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2721  hypothetical protein  31.91 
 
 
369 aa  132  1e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504995  decreased coverage  6.94638e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.67 
 
 
369 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.37 
 
 
357 aa  130  4e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  5.89755e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.3 
 
 
368 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.97 
 
 
369 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
367 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.42 
 
 
378 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.12 
 
 
373 aa  121  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  30.51 
 
 
368 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.02 
 
 
372 aa  120  5e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.012041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.28 
 
 
368 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  31.32 
 
 
367 aa  117  2e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.34 
 
 
368 aa  117  4e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.241383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.75 
 
 
367 aa  114  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.87 
 
 
371 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.76 
 
 
368 aa  111  2e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.43 
 
 
368 aa  111  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.45 
 
 
368 aa  109  8e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.58 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1109  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.9 
 
 
365 aa  85.5  1e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.195082  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.56 
 
 
368 aa  82.8  8e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
370 aa  80.5  4e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.79 
 
 
367 aa  78.6  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79459e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.44 
 
 
367 aa  78.2  2e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.41 
 
 
345 aa  77.4  3e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.71 
 
 
384 aa  77  5e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.76 
 
 
381 aa  75.5  1e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.56 
 
 
369 aa  70.5  4e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1277  hypothetical protein  44.44 
 
 
92 aa  54.7  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4368  hypothetical protein  39.39 
 
 
123 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>