More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0897 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  100 
 
 
453 aa  899  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.62958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  39.78 
 
 
463 aa  320  2e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  39.78 
 
 
463 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  36.97 
 
 
453 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  34.8 
 
 
479 aa  283  5e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
458 aa  275  1e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  33.78 
 
 
445 aa  275  1e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.18772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  33.63 
 
 
458 aa  274  2e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
450 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  33.85 
 
 
445 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  32.2 
 
 
461 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  31.25 
 
 
460 aa  230  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
455 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  29.89 
 
 
459 aa  221  2e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
456 aa  213  6e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  29.89 
 
 
460 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  28.82 
 
 
461 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  29.27 
 
 
461 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  28.19 
 
 
458 aa  201  2e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  29.85 
 
 
458 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
484 aa  196  8e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.92336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  29.05 
 
 
458 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
449 aa  184  2e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  30.54 
 
 
454 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
461 aa  171  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
472 aa  163  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  25.86 
 
 
463 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
453 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.76954e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.72 
 
 
463 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.27796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
475 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.56724e-11  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
458 aa  149  1e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.5 
 
 
464 aa  147  4e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.25629e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  24.72 
 
 
463 aa  147  4e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
469 aa  146  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  24.02 
 
 
464 aa  146  8e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.17655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.5 
 
 
464 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.4435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
464 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.60081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
464 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  6.55029e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
456 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.54 
 
 
464 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  9.23462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  24.54 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
464 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
456 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.80901e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
464 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25 
 
 
450 aa  134  4e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
450 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
483 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
442 aa  129  7e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.74233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
446 aa  129  8e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.56 
 
 
464 aa  129  9e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.38189e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
469 aa  122  1e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
475 aa  122  1e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
468 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.62 
 
 
464 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  23.49 
 
 
450 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  20.4 
 
 
446 aa  119  8e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  22.9 
 
 
445 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.31388e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.44 
 
 
446 aa  119  1e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  25 
 
 
449 aa  119  1e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
445 aa  118  2e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
464 aa  117  4e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
464 aa  116  8e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  24.45 
 
 
446 aa  115  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.39 
 
 
495 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.39345e-07  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
454 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
459 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  24.07 
 
 
444 aa  113  8e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25 
 
 
462 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  3.17216e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.84 
 
 
466 aa  112  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.17 
 
 
484 aa  112  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.3845e-09  hitchhiker  3.34983e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
453 aa  111  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.17 
 
 
546 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.0697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.17 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
495 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.35228e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.17 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
469 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.17 
 
 
546 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  23.85 
 
 
440 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.69 
 
 
486 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
453 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
504 aa  110  7e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.95 
 
 
484 aa  109  8e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.99298e-08  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.45 
 
 
469 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
486 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  21.97 
 
 
446 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  23.97 
 
 
498 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  21.22 
 
 
461 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.5823e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  25.13 
 
 
452 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.59 
 
 
469 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.59 
 
 
469 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.59 
 
 
469 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.59 
 
 
469 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
468 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.02645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
453 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
442 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.83437e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.46 
 
 
459 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.35028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  22.8 
 
 
440 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  22.03 
 
 
500 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.38 
 
 
469 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  24.01 
 
 
451 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>