202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0893 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  50.27 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  48.7 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  50.52 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  50.52 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  46.88 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  46.88 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  46.03 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  45.45 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  44.74 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  45.26 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  42.49 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  43.16 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  44.04 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  42.55 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  44.27 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  42.49 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  41.45 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  43.98 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  44.74 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  43.39 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  44.04 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  42.19 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  43.16 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  42.63 
 
 		 190 aa  160  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.68 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  41.58 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  43.46 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  42.55 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  42.86 
 
 		 179 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  39.9 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  40.84 
 
 		 180 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.96 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  39.9 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.27 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  40.43 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  43.01 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.58 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  40.64 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  40.41 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  41.49 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  38.22 
 
 		 191 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  40.11 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  39.68 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  39.57 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  40.62 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  38.22 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  40.21 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  40.21 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.68 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.04 
 
 		 392 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  35.75 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  35.75 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  40.32 
 
 		 696 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  39.68 
 
 		 696 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  42.33 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  39.47 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  38.95 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  38.95 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  38.04 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  35.94 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  35.79 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  34.21 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  34.21 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  34.72 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  34.21 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  35.14 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  35.36 
 
 		 164 aa  104  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  33.51 
 
 		 172 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  32.22 
 
 		 165 aa  98.2  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  38.46 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  39.86 
 
 		 139 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  39.86 
 
 		 139 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  39.86 
 
 		 139 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  33.52 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  35.87 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  33.7 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  38.03 
 
 		 140 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  31.52 
 
 		 165 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  38.73 
 
 		 146 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  36.73 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  38.03 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  36.62 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  36.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  37.32 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  35.92 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  35.92 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  39.29 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  34.23 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  35.21 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  31.72 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  34.51 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  34.51 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  35.21 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  35.21 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  35.21 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  35.46 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  34.51 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>