More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0860 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  36.11 
 
 
2727 aa  1249  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  37.51 
 
 
5915 aa  1225  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  32.68 
 
 
2006 aa  642  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  36.75 
 
 
5822 aa  1224  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  40.87 
 
 
4649 aa  690  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  54.17 
 
 
5566 aa  686  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  32.34 
 
 
6876 aa  1077  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  52.34 
 
 
3925 aa  673  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  39.89 
 
 
5628 aa  762  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  39.11 
 
 
4588 aa  955  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  44.9 
 
 
5612 aa  654  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.86 
 
 
2284 aa  756  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  34.19 
 
 
7149 aa  1140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  41.3 
 
 
1911 aa  770  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  29.45 
 
 
4429 aa  795  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  40.11 
 
 
1696 aa  892  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 
5802 aa  955  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 
1613 aa  649  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  36.8 
 
 
5778 aa  1226  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  37.6 
 
 
5993 aa  1231  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 
3231 aa  1051  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  35.26 
 
 
2393 aa  663  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  47.29 
 
 
3525 aa  2066  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
4036 aa  8314  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  49.62 
 
 
1601 aa  1487  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
2725 aa  1059  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  43.8 
 
 
7157 aa  2006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  38.71 
 
 
4212 aa  754  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  53.62 
 
 
1315 aa  686  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  53.79 
 
 
4869 aa  805  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  33.81 
 
 
1717 aa  644  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  49.85 
 
 
1440 aa  1202  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  51.96 
 
 
5854 aa  2936  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  44.99 
 
 
4539 aa  608  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  45.19 
 
 
4555 aa  610  1e-172  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  33.52 
 
 
4874 aa  605  1e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  33.58 
 
 
5023 aa  602  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  44.65 
 
 
2653 aa  602  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  33.71 
 
 
3818 aa  602  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
2551 aa  593  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  41.78 
 
 
4122 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  36.97 
 
 
5021 aa  591  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  41.83 
 
 
4048 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  29.93 
 
 
3695 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  41.69 
 
 
4101 aa  586  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  41.69 
 
 
4098 aa  587  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  41.91 
 
 
4157 aa  587  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  41.69 
 
 
4580 aa  587  1e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  41.98 
 
 
4123 aa  583  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  47.44 
 
 
1262 aa  581  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  50.8 
 
 
2726 aa  576  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  50.8 
 
 
4614 aa  577  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.09 
 
 
2363 aa  564  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  40.38 
 
 
2260 aa  556  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  44.63 
 
 
2463 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  39.74 
 
 
2501 aa  544  1e-152  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  41.6 
 
 
1749 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 
3099 aa  538  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  42.47 
 
 
1619 aa  533  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.59 
 
 
4478 aa  529  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
3645 aa  527  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  36.94 
 
 
3811 aa  519  1e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.11 
 
 
3696 aa  516  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 
3702 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.38 
 
 
3693 aa  491  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.38 
 
 
3693 aa  491  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  26.86 
 
 
4080 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  33.97 
 
 
3176 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  26.96 
 
 
3781 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  30.2 
 
 
3130 aa  486  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  26.98 
 
 
3780 aa  484  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.58 
 
 
2880 aa  484  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.4 
 
 
3930 aa  484  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  44.6 
 
 
591 aa  479  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  39.72 
 
 
2063 aa  478  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.73 
 
 
3676 aa  474  1e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.95 
 
 
3679 aa  474  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  27.54 
 
 
3494 aa  464  1e-128  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  31.78 
 
 
4646 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  31.45 
 
 
3108 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  30.29 
 
 
3463 aa  457  1e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 
1656 aa  457  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  30.95 
 
 
7279 aa  453  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  31.04 
 
 
3093 aa  453  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
7110 aa  449  1e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  26.1 
 
 
4882 aa  448  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  29.49 
 
 
3711 aa  447  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  28.22 
 
 
4183 aa  448  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  43.99 
 
 
2551 aa  447  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  29.47 
 
 
3427 aa  441  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  38.85 
 
 
2082 aa  441  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.5 
 
 
2462 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  40.54 
 
 
1272 aa  437  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  31.21 
 
 
5255 aa  432  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.21 
 
 
7210 aa  434  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  31.87 
 
 
6768 aa  434  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  32.53 
 
 
3449 aa  430  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  38.42 
 
 
3739 aa  426  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  30.36 
 
 
2975 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  31.55 
 
 
4151 aa  428  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>