More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0854 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  44.54 
 
 
790 aa  702    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  56.48 
 
 
764 aa  941    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  100 
 
 
803 aa  1640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  49.08 
 
 
1154 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  45.53 
 
 
481 aa  459  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  45.91 
 
 
865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  45.89 
 
 
549 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.87 
 
 
545 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  44.87 
 
 
545 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  44.65 
 
 
542 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.19 
 
 
541 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.68 
 
 
552 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.19 
 
 
542 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.52 
 
 
537 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  40.2 
 
 
548 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  43.06 
 
 
550 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  44.04 
 
 
547 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  40.4 
 
 
548 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  40.4 
 
 
548 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  44.27 
 
 
542 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  40.08 
 
 
548 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.29 
 
 
532 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.81 
 
 
550 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.4 
 
 
552 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.81 
 
 
550 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.81 
 
 
548 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.75 
 
 
531 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  43.98 
 
 
556 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  40.13 
 
 
530 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  41.34 
 
 
554 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  42.26 
 
 
557 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.8 
 
 
525 aa  366  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  39.86 
 
 
477 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  38.37 
 
 
542 aa  364  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  40.65 
 
 
554 aa  360  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.36 
 
 
554 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.42 
 
 
554 aa  352  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  40.55 
 
 
526 aa  347  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.28 
 
 
553 aa  343  7e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.46 
 
 
410 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  37.95 
 
 
539 aa  313  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1475  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50.18 
 
 
437 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00398178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1389  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.82 
 
 
390 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2616  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.82 
 
 
390 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0488176  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0174  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.47 
 
 
452 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1125  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.47 
 
 
452 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0451  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.47 
 
 
452 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0265499  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1209  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.47 
 
 
394 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.059657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1434  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.22 
 
 
377 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.89 
 
 
1055 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.15 
 
 
2284 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1433  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.94 
 
 
623 aa  247  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2098  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.14 
 
 
299 aa  245  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2512  putative acyltransferase  45.29 
 
 
282 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2602  putative acyltransferase  45.29 
 
 
282 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.78 
 
 
309 aa  238  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.2 
 
 
313 aa  231  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2977  putative acyltransferase  44.87 
 
 
264 aa  230  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  hitchhiker  0.0000388716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.38 
 
 
314 aa  227  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.95 
 
 
319 aa  226  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.79 
 
 
313 aa  221  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0336623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.66 
 
 
324 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3992  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.96 
 
 
297 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.89 
 
 
314 aa  218  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2469  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  43.3 
 
 
291 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1850  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.582901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0428  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0839  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0524  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.06 
 
 
299 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1456  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.84 
 
 
293 aa  215  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  0.0451316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.97 
 
 
293 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.97 
 
 
293 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1276  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.89 
 
 
310 aa  213  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00229731  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1087  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  37.91 
 
 
310 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.930156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1724  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.16 
 
 
309 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000284563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0947  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  38.33 
 
 
312 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010445  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0013  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.41 
 
 
306 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4573  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  37.54 
 
 
321 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124342  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1971  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.8 
 
 
313 aa  208  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.67 
 
 
324 aa  208  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1343  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.34 
 
 
319 aa  208  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.374742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1804  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.65 
 
 
290 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1059  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.54 
 
 
310 aa  207  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000649823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40 
 
 
309 aa  207  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1602  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.51 
 
 
307 aa  206  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5012  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.35 
 
 
291 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2015  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.71 
 
 
293 aa  206  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.28 
 
 
314 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1743  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.13 
 
 
306 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1832  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.29 
 
 
290 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3675  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.28 
 
 
314 aa  204  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1437  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.79 
 
 
304 aa  203  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3285  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.72 
 
 
306 aa  203  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0138  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.83 
 
 
293 aa  203  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.488001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.31 
 
 
311 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4158  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  39.44 
 
 
312 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.28 
 
 
304 aa  203  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1730  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.84 
 
 
290 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.21848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>