292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0845 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  100 
 
 
252 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  6.78199e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  69.27 
 
 
506 aa  316  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.98497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  44.96 
 
 
496 aa  200  2e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
494 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 
548 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
554 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
542 aa  165  6e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  34.36 
 
 
482 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  37.2 
 
 
211 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  30.92 
 
 
517 aa  134  2e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  30.9 
 
 
485 aa  127  2e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 
510 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  31.58 
 
 
563 aa  121  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  31.69 
 
 
555 aa  121  1e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  32.85 
 
 
561 aa  115  8e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  31.25 
 
 
561 aa  113  2e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  32.67 
 
 
547 aa  110  2e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.69 
 
 
551 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  30.71 
 
 
542 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  30.71 
 
 
542 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  29.26 
 
 
590 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  30.71 
 
 
542 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  28.82 
 
 
490 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  8.86482e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 
521 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.49 
 
 
546 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  1.7806e-10 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  30.13 
 
 
540 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  29.83 
 
 
537 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  29.13 
 
 
579 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 
565 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  29.65 
 
 
518 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
549 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.27 
 
 
578 aa  99.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  29.34 
 
 
550 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 
555 aa  99  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  30.17 
 
 
540 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  29.5 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.84 
 
 
515 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91937e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.05 
 
 
462 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  29.86 
 
 
489 aa  92.4  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.99 
 
 
541 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  30.68 
 
 
549 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  29.5 
 
 
606 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  29.5 
 
 
606 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.14 
 
 
544 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  27.2 
 
 
558 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  3.13732e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  30.49 
 
 
597 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.91 
 
 
500 aa  89  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  30.96 
 
 
442 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.19867e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
564 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  28.96 
 
 
336 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  28.3 
 
 
662 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  28.17 
 
 
584 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  28.17 
 
 
551 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  30.04 
 
 
511 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  29.64 
 
 
539 aa  84.7  1e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  29.41 
 
 
546 aa  84.7  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  30.18 
 
 
519 aa  85.1  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.72315e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.08 
 
 
537 aa  85.1  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
415 aa  84  2e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  29.39 
 
 
601 aa  83.2  3e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  29.39 
 
 
578 aa  83.2  3e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 
519 aa  83.6  3e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.38 
 
 
558 aa  83.2  3e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 
576 aa  83.2  4e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  28.51 
 
 
539 aa  83.2  4e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.57 
 
 
522 aa  82.4  6e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  24.9 
 
 
542 aa  82.4  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.06 
 
 
569 aa  82  9e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  31.7 
 
 
558 aa  82  9e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  30.14 
 
 
521 aa  81.6  1e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.15 
 
 
524 aa  80.9  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  29.35 
 
 
513 aa  79.7  4e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  29.06 
 
 
430 aa  79.7  4e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27.24 
 
 
552 aa  79.7  4e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  28.98 
 
 
562 aa  79.7  4e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  32.76 
 
 
421 aa  79.3  5e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  28.7 
 
 
431 aa  79.3  6e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  6.12209e-09 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 
281 aa  79  7e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  29.12 
 
 
441 aa  78.6  8e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 
546 aa  78.6  8e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  28.9 
 
 
547 aa  78.6  9e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  30.15 
 
 
520 aa  78.2  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
511 aa  77.8  2e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  27.41 
 
 
487 aa  77  2e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  25.77 
 
 
521 aa  75.9  6e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  29.15 
 
 
543 aa  75.9  6e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27.94 
 
 
626 aa  75.5  7e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  29.1 
 
 
277 aa  75.5  8e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.86 
 
 
522 aa  74.7  1e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  25.43 
 
 
532 aa  74.3  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  28.5 
 
 
564 aa  73.9  2e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.72 
 
 
526 aa  73.9  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  25.68 
 
 
537 aa  73.6  3e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  24.9 
 
 
542 aa  73.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  8.29411e-06 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  27.27 
 
 
552 aa  73.2  4e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  27.4 
 
 
535 aa  73.2  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 
522 aa  73.2  4e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.29 
 
 
429 aa  72.8  5e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  24.87 
 
 
598 aa  72.8  5e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.21 
 
 
484 aa  72.8  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.73859e-15 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>