197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0840 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 584 aa  1209    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  58.7 
 
 		 900 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  42.19 
 
 		 566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 		 335 aa  228  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  39.35 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  36.4 
 
 		 335 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  31.96 
 
 		 332 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  37.02 
 
 		 312 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  34.8 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 		 814 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  32.24 
 
 		 593 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  31.6 
 
 		 572 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  30.33 
 
 		 681 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  30.9 
 
 		 572 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 332 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.22 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  29.55 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  26.86 
 
 		 475 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  29.23 
 
 		 621 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  27.83 
 
 		 578 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  27.71 
 
 		 743 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  28.96 
 
 		 673 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  29.77 
 
 		 589 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 377 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  25.86 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  27.43 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.07 
 
 		 370 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 502 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  21.08 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  21.12 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  46.51 
 
 		 722 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  55.36 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  24.16 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  58.82 
 
 		 885 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  24.92 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  27.72 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  57.89 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  56.9 
 
 		 873 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  46.88 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  54.39 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  46.84 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  50.88 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  57.41 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  55.17 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  56.14 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  62.07 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 		 1122 aa  63.9  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  60 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 		 746 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  25.36 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  60 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  20.58 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  56.14 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  59.26 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  23.45 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  28.57 
 
 		 466 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  48.44 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 895 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  19.95 
 
 		 365 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  55.17 
 
 		 949 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  52.54 
 
 		 874 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1473  glycoside hydrolase family 5  24.26 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  52.63 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0022  hypothetical protein  21.09 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  49.12 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  22.12 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  24.7 
 
 		 420 aa  57  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  50.88 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 		 337 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  51.72 
 
 		 833 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  34.26 
 
 		 848 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 1224 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  59.52 
 
 		 676 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  42.65 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.48 
 
 		 948 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  24.81 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  44.83 
 
 		 391 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  26.09 
 
 		 505 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.79 
 
 		 537 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  51.72 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.48 
 
 		 551 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 		 580 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  35.16 
 
 		 552 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  22.91 
 
 		 349 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  47.37 
 
 		 298 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  25.17 
 
 		 491 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  44.44 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>