272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0776 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 59 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  78.57 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  61.02 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  57.63 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  49.12 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  60 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  47.46 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  59.52 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  52.63 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50 
 
 		 58 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1267  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>