More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0772 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 131 aa  262  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  84.09 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  71.97 
 
 		 132 aa  197  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  68.94 
 
 		 132 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  65.91 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  65.38 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  64.39 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  65.91 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  62.88 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  64.62 
 
 		 134 aa  176  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  64.62 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  64.62 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  63.64 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  64.12 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  60.45 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  61.36 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  62.88 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  62.88 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  60.61 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  59.4 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 133 aa  156  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 134 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  55.56 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 133 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  59.38 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  56.82 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  58.21 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  55.88 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  55.97 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  56.39 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  53.85 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  56.72 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  53.08 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>