More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0770 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  78.89 
 
 		 182 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  74.01 
 
 		 181 aa  283  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  71.67 
 
 		 180 aa  279  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 		 179 aa  279  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 		 179 aa  279  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 		 179 aa  276  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  71.11 
 
 		 180 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  68.72 
 
 		 179 aa  274  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  68.72 
 
 		 179 aa  274  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 180 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 179 aa  270  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 180 aa  262  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 180 aa  260  6.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  258  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  258  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  257  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 180 aa  256  8e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 180 aa  256  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  256  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 180 aa  254  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  254  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  254  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  61.8 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  61.58 
 
 		 181 aa  241  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  240  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 180 aa  240  7e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 186 aa  240  7.999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 192 aa  240  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 181 aa  239  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.66 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000492925  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 184 aa  234  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>