143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0752 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  71.14 
 
 
591 aa  883    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  100 
 
 
577 aa  1189    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
590 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  41.52 
 
 
857 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  40.28 
 
 
583 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.61 
 
 
469 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35.58 
 
 
815 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6532  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.52 
 
 
584 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  33.59 
 
 
532 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0629  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  35.86 
 
 
417 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.286201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 
728 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0016  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.04 
 
 
558 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.98 
 
 
701 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07413  endomannanase (Eurofung)  35.17 
 
 
355 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3691  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.2 
 
 
506 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000437019  normal  0.102823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03336  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
315 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139072  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  31.82 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5393  glycoside hydrolase family 26  32.34 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000752871  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1626  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 
506 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  32.49 
 
 
694 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0467  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.34 
 
 
380 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3032  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.81 
 
 
385 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.74 
 
 
409 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2729  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.52 
 
 
383 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03326  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
341 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.73 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4953  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
376 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0519766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.81 
 
 
711 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
541 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3531  glycoside hydrolase family 26  28.87 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  31.72 
 
 
780 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  54.84 
 
 
746 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2491  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
458 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  42.31 
 
 
532 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  38.1 
 
 
955 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  48.61 
 
 
604 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  46.97 
 
 
725 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  42.5 
 
 
298 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.25 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  49.28 
 
 
391 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  46.97 
 
 
435 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  31.52 
 
 
536 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.06 
 
 
324 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  48.39 
 
 
1122 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  43.28 
 
 
567 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  42.25 
 
 
539 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  51.67 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  44.93 
 
 
873 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  43.66 
 
 
707 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  27.18 
 
 
554 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  49.18 
 
 
686 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
778 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  46.43 
 
 
874 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.59 
 
 
469 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  36.71 
 
 
639 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  45.16 
 
 
715 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  39.71 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  41.27 
 
 
477 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 
1015 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  39.13 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  36.25 
 
 
861 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.49 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  31.94 
 
 
848 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  39.44 
 
 
424 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  41.79 
 
 
646 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  32.95 
 
 
443 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  43.08 
 
 
722 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2271  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 
178 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00813708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  42.19 
 
 
885 aa  54.3  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  42.67 
 
 
460 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  31.18 
 
 
739 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  38.96 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  34.88 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
895 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  49.15 
 
 
833 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
842 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  39.06 
 
 
621 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.88 
 
 
710 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 
566 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
683 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  48.21 
 
 
584 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 
736 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  36 
 
 
679 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.1 
 
 
790 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.32 
 
 
831 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  42.62 
 
 
737 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
1051 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.37 
 
 
490 aa  51.2  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  36.92 
 
 
436 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.76 
 
 
471 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.5 
 
 
511 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  43.55 
 
 
308 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 
730 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1164 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  35.71 
 
 
425 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  44.26 
 
 
482 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  28.03 
 
 
348 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
1077 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  41.18 
 
 
949 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.29 
 
 
537 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>