151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0750 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  100 
 
 
298 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  69.1 
 
 
683 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  57.71 
 
 
357 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  62.5 
 
 
356 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  2.83811e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  48.65 
 
 
334 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  48.87 
 
 
428 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  51.27 
 
 
338 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  50.76 
 
 
767 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.94565e-06  decreased coverage  3.02702e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  46.12 
 
 
380 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  50.25 
 
 
494 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  44.34 
 
 
333 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  51.6 
 
 
524 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  44.98 
 
 
233 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  48.47 
 
 
343 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  49.25 
 
 
692 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  50.26 
 
 
411 aa  185  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  49.25 
 
 
1001 aa  184  2e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  45.13 
 
 
338 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  44.44 
 
 
225 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  47.67 
 
 
221 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  38.27 
 
 
1160 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  6.00941e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  47.09 
 
 
212 aa  155  5e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  42.24 
 
 
212 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.21403e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  34.91 
 
 
337 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  36.2 
 
 
274 aa  121  1e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
221 aa  78.6  1e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  55.22 
 
 
391 aa  78.2  2e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  36.29 
 
 
679 aa  76.3  6e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
837 aa  72  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 
873 aa  71.6  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.39 
 
 
511 aa  71.2  2e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  56.25 
 
 
460 aa  70.9  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  45.33 
 
 
646 aa  70.5  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  52.24 
 
 
477 aa  70.1  5e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.71564e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  48.39 
 
 
424 aa  69.7  6e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  50.7 
 
 
583 aa  69.7  6e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.98696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  51.39 
 
 
423 aa  69.7  6e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  51.61 
 
 
965 aa  69.3  7e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 
928 aa  68.9  9e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.25 
 
 
807 aa  68.6  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  50.72 
 
 
885 aa  68.9  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  49.15 
 
 
833 aa  66.6  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 
501 aa  66.6  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 
533 aa  65.9  7e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46.77 
 
 
621 aa  65.1  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  34.35 
 
 
778 aa  65.1  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
536 aa  64.7  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  39.76 
 
 
707 aa  64.7  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
541 aa  65.1  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  46.27 
 
 
725 aa  64.3  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 
533 aa  63.9  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  43.08 
 
 
949 aa  63.5  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  37.97 
 
 
948 aa  63.2  5e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  44.78 
 
 
475 aa  63.2  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
737 aa  62.8  8e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  51.67 
 
 
686 aa  62.4  9e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.27885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  46.58 
 
 
532 aa  61.6  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 
746 aa  61.6  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  42.5 
 
 
577 aa  62.4  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.40761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  48.39 
 
 
526 aa  62.4  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.24089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  47.62 
 
 
982 aa  62  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  37.97 
 
 
639 aa  61.2  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  39.74 
 
 
604 aa  60.8  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 
591 aa  61.2  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  45.16 
 
 
316 aa  60.1  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  41.79 
 
 
539 aa  60.5  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 
780 aa  60.5  4e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 
534 aa  59.7  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  39.47 
 
 
425 aa  59.7  6e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  42.65 
 
 
303 aa  59.3  7e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  30.83 
 
 
630 aa  59.3  8e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  40 
 
 
554 aa  58.9  9e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  45 
 
 
732 aa  58.5  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  47.62 
 
 
308 aa  58.5  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
736 aa  58.9  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 
1122 aa  58.5  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  34 
 
 
435 aa  58.9  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.88378e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 
1077 aa  58.9  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  47.37 
 
 
560 aa  57.8  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  39.13 
 
 
537 aa  57.8  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 
710 aa  57.8  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.77 
 
 
710 aa  57.8  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 
961 aa  57.8  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  40.28 
 
 
436 aa  57.8  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  48.39 
 
 
874 aa  58.2  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  29.56 
 
 
600 aa  58.2  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
590 aa  57  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  38.57 
 
 
922 aa  57  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  44.93 
 
 
295 aa  56.6  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  48.44 
 
 
311 aa  57  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.28 
 
 
1209 aa  56.6  5e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.88 
 
 
469 aa  55.8  7e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.67445e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.82 
 
 
1051 aa  55.8  8e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  43.94 
 
 
955 aa  55.8  8e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.14 
 
 
471 aa  55.8  9e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  36.92 
 
 
567 aa  55.8  9e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
895 aa  55.5  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.5 
 
 
411 aa  54.3  2e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 
1015 aa  54.7  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.98242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  42.65 
 
 
715 aa  54.7  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>