More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0746 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 
828 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
797 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
799 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 
836 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  53.23 
 
 
794 aa  841    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
840 aa  734    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 
799 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  57.11 
 
 
805 aa  898    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  45.04 
 
 
821 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.35 
 
 
852 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
826 aa  699    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  46.47 
 
 
804 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  57.32 
 
 
798 aa  873    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  56.98 
 
 
805 aa  871    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  56.98 
 
 
805 aa  870    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  56.98 
 
 
805 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  47.51 
 
 
836 aa  728    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
1061 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
835 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
937 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
833 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  57.11 
 
 
806 aa  876    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  43.77 
 
 
799 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
762 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
819 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  50.36 
 
 
954 aa  742    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  45.33 
 
 
790 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
753 aa  787    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  42.3 
 
 
1061 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  44.87 
 
 
823 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  45.27 
 
 
797 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  46.91 
 
 
797 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
834 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
833 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  43.38 
 
 
1040 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  47.14 
 
 
817 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.25 
 
 
798 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  43.06 
 
 
868 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  56.98 
 
 
805 aa  871    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  49.53 
 
 
747 aa  716    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  49.94 
 
 
801 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  45.54 
 
 
827 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  48.5 
 
 
857 aa  773    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  50.43 
 
 
836 aa  803    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 
805 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.3 
 
 
762 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
1063 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 
885 aa  770    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
828 aa  704    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
800 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  62.78 
 
 
797 aa  991    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
816 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.52 
 
 
827 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  52.44 
 
 
804 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  50.49 
 
 
942 aa  757    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  44.4 
 
 
841 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  42.3 
 
 
1063 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
813 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  47.47 
 
 
838 aa  755    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.39 
 
 
836 aa  761    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.78 
 
 
833 aa  712    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
759 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
905 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  43.04 
 
 
1021 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
1182 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  58.24 
 
 
821 aa  923    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  49.87 
 
 
751 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  52.28 
 
 
817 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
813 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
855 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  46.29 
 
 
804 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  51.28 
 
 
889 aa  789    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  51.52 
 
 
889 aa  787    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  50.53 
 
 
758 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  41.22 
 
 
821 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  42.18 
 
 
1061 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  52.93 
 
 
802 aa  841    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  58.46 
 
 
799 aa  937    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
946 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  45.15 
 
 
792 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  47.04 
 
 
742 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  43.04 
 
 
1021 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
839 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
814 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
838 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  45.04 
 
 
790 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  49.87 
 
 
786 aa  724    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  49.1 
 
 
837 aa  768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  42.89 
 
 
872 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  75.38 
 
 
743 aa  1135    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
803 aa  911    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  52.93 
 
 
802 aa  841    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.96 
 
 
820 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
829 aa  666    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  55.83 
 
 
796 aa  856    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  46.1 
 
 
866 aa  738    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  42.74 
 
 
1013 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  46.28 
 
 
759 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
844 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 
836 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>