More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0745 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
471 aa  948    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  59.15 
 
 
499 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  55.51 
 
 
621 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  39.37 
 
 
263 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  34.65 
 
 
228 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  32.16 
 
 
226 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  31.96 
 
 
410 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  31.28 
 
 
393 aa  96.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  31.92 
 
 
409 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  33.18 
 
 
233 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  34.84 
 
 
219 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  30.14 
 
 
221 aa  90.5  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  33.94 
 
 
219 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  29.44 
 
 
226 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  29.17 
 
 
235 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  31.92 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  30.39 
 
 
224 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  31.6 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  31.8 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  30.15 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  29.63 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  27.8 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  27.88 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  27.88 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  27.88 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  28.95 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  28.45 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  28.16 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  27.05 
 
 
235 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  26.44 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  28.32 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3376  hypothetical protein  28.51 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  26.44 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  26.44 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  31.46 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  29.84 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  24.18 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  29.86 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  26.44 
 
 
234 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  29.19 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  31.28 
 
 
274 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  27.66 
 
 
249 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  27.4 
 
 
211 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  27.62 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  26.51 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  29.63 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  26.57 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  27.65 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  37 
 
 
889 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  27.27 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  27.68 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  30.43 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  27.68 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 
889 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  27.53 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  28 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  28.96 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  29.38 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  31.4 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  28.28 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0720  hypothetical protein  32.65 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0477616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  28.44 
 
 
273 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3557  hypothetical protein  27.55 
 
 
232 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0172503  normal  0.774445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  29.72 
 
 
221 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  27.06 
 
 
225 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  29.72 
 
 
225 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  28.72 
 
 
225 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  30.23 
 
 
220 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4081  hypothetical protein  33.14 
 
 
235 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  27.84 
 
 
223 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  26.57 
 
 
228 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0577  heavy metal translocating P-type ATPase  29.55 
 
 
842 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.951619  normal  0.619407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  27.71 
 
 
227 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  27.71 
 
 
227 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  28.93 
 
 
232 aa  60.1  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  28 
 
 
239 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0576  hypothetical protein  26.19 
 
 
279 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0856861  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  26.79 
 
 
279 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.98 
 
 
833 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  26.07 
 
 
230 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  29.11 
 
 
223 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
78 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
942 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
709 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.93 
 
 
797 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  25.42 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
802 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  44.44 
 
 
68 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
796 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  44.44 
 
 
68 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
839 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>