121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0740 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  71.79 
 
 		 566 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  79.53 
 
 		 468 aa  770    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 534 aa  1088    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  51.36 
 
 		 526 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  50.33 
 
 		 1414 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  50.22 
 
 		 619 aa  445  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  50.46 
 
 		 633 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  50.58 
 
 		 597 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.74 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.87 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  42.83 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  47.71 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  48.64 
 
 		 658 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 		 660 aa  347  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  32.18 
 
 		 608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  32.59 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.89 
 
 		 2305 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.99 
 
 		 2310 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  29.43 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  29.21 
 
 		 496 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  28.39 
 
 		 614 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 440 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  25.23 
 
 		 725 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  43.02 
 
 		 715 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  44.71 
 
 		 737 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  55.36 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  50.85 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  57.38 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 		 526 aa  67  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  50.72 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  44.58 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  44.29 
 
 		 583 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  49.3 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  37.76 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  41.86 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  48.21 
 
 		 1224 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  43.55 
 
 		 780 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  53.23 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  38.57 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  43.24 
 
 		 873 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  40.48 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  44.64 
 
 		 746 aa  60.1  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  43.75 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  49.21 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  48.21 
 
 		 604 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  47.83 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  42.86 
 
 		 955 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 		 895 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  20.66 
 
 		 590 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  46.77 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  38.1 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  42.25 
 
 		 949 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.44 
 
 		 537 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  44.64 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  41.18 
 
 		 391 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  37.14 
 
 		 541 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  45.61 
 
 		 874 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  40.68 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  22.12 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  49.09 
 
 		 308 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  41.27 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  41.79 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  25.84 
 
 		 948 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  47.62 
 
 		 646 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 580 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.43 
 
 		 528 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.16 
 
 		 842 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 1601 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 707 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  36.36 
 
 		 316 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 736 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  20.22 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  36.67 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  35.48 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  44.64 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  44.64 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  40.3 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  41.27 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 961 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.59 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  39.34 
 
 		 311 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.68 
 
 		 469 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  42.11 
 
 		 833 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.27 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 590 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  41.89 
 
 		 951 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  39.34 
 
 		 591 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  40.68 
 
 		 424 aa  47  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 		 649 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  21.68 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.46 
 
 		 848 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  37.7 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>