164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0731 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  62.02 
 
 
887 aa  801    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  55.26 
 
 
739 aa  827    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  56.16 
 
 
736 aa  807    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  57.51 
 
 
730 aa  863    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  56.42 
 
 
1369 aa  738    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  61.82 
 
 
1759 aa  821    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  62.76 
 
 
985 aa  882    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
725 aa  1494    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  46.31 
 
 
710 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.94 
 
 
846 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50.89 
 
 
880 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  44.29 
 
 
715 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  49.92 
 
 
847 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  43.3 
 
 
742 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  45.77 
 
 
794 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  46.65 
 
 
990 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  43.09 
 
 
737 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  45.52 
 
 
1137 aa  527  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  41.84 
 
 
1017 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  39 
 
 
686 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 
707 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  34.96 
 
 
757 aa  422  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  41.75 
 
 
526 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  34.12 
 
 
778 aa  360  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 
928 aa  349  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 
563 aa  347  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 
789 aa  345  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
961 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  32.08 
 
 
949 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  32.69 
 
 
984 aa  334  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.99 
 
 
854 aa  313  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  36.4 
 
 
611 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
894 aa  276  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  30.5 
 
 
590 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.74 
 
 
2042 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.23 
 
 
978 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  24.8 
 
 
571 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 
649 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  51.65 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  26.05 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  53.62 
 
 
475 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  25.06 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.3 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 
895 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.37 
 
 
867 aa  74.3  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  22.54 
 
 
1100 aa  74.3  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  23.92 
 
 
591 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 
873 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  22.38 
 
 
537 aa  73.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
1224 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  52.31 
 
 
955 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  60.56 
 
 
885 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.55 
 
 
998 aa  71.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  49.32 
 
 
780 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  46.97 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  56.06 
 
 
435 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  51.9 
 
 
532 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  54.1 
 
 
1015 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  49.25 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  49.21 
 
 
621 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  53.73 
 
 
524 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  57.81 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  39.74 
 
 
423 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  52.46 
 
 
536 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  24.95 
 
 
854 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.37 
 
 
927 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  44.58 
 
 
534 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  57.14 
 
 
722 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 
951 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  44.29 
 
 
462 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 
541 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 
812 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  46.27 
 
 
436 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  46.27 
 
 
298 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  47.54 
 
 
746 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  60 
 
 
584 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
563 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  43.08 
 
 
316 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  52.46 
 
 
1122 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  22.44 
 
 
1105 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  23.21 
 
 
874 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  46.97 
 
 
577 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  44.44 
 
 
295 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  52.31 
 
 
490 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.58 
 
 
1051 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  44.29 
 
 
425 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  23.34 
 
 
864 aa  61.6  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  47.95 
 
 
848 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 
1601 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  42.03 
 
 
567 aa  60.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
590 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  46.48 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 
604 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  43.94 
 
 
303 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  42.67 
 
 
415 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.44 
 
 
786 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  50.79 
 
 
861 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  58.06 
 
 
460 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  38.75 
 
 
900 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  42.65 
 
 
412 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>