102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0699 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  100 
 
 
627 aa  1267  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.94308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  62.78 
 
 
629 aa  799  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  62.82 
 
 
629 aa  792  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  43.98 
 
 
612 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  40.54 
 
 
614 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  4.27762e-06  unclonable  1.51298e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  39.75 
 
 
614 aa  468  1e-130  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  40.45 
 
 
609 aa  453  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  40.87 
 
 
608 aa  454  1e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  40.45 
 
 
609 aa  453  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.41492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  41.42 
 
 
611 aa  452  1e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  40.87 
 
 
608 aa  452  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.52812e-08  decreased coverage  4.41814e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 
611 aa  445  1e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  40.77 
 
 
608 aa  446  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  40.94 
 
 
585 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.68 
 
 
627 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.00657e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  39.38 
 
 
609 aa  439  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  40.58 
 
 
608 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  36.84 
 
 
693 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  37.75 
 
 
683 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  40.42 
 
 
608 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.00582e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.97 
 
 
781 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  40.23 
 
 
608 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.21839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  40.39 
 
 
608 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  40.42 
 
 
608 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  40.58 
 
 
608 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  39.49 
 
 
672 aa  418  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  38.83 
 
 
615 aa  417  1e-115  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  37.15 
 
 
668 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  36.71 
 
 
636 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  35.78 
 
 
672 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  35.55 
 
 
731 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 
664 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  36.42 
 
 
685 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  37.11 
 
 
674 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  36.69 
 
 
672 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 
664 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  35.43 
 
 
677 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 
664 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 
664 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  35.89 
 
 
615 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  36.27 
 
 
658 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3335e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  36.45 
 
 
654 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 
664 aa  379  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  35.82 
 
 
681 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.46 
 
 
614 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  35.71 
 
 
682 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  3.28435e-05  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  35.79 
 
 
704 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  35.38 
 
 
674 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  34.9 
 
 
678 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  35.62 
 
 
696 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  34.32 
 
 
655 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  36.61 
 
 
614 aa  364  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  35.75 
 
 
615 aa  358  2e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  34.78 
 
 
667 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.32 
 
 
657 aa  354  3e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  35.98 
 
 
691 aa  353  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  33.13 
 
 
750 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  36.39 
 
 
612 aa  349  8e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.70343e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  35.02 
 
 
678 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  36.04 
 
 
667 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 
653 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  36.1 
 
 
677 aa  341  3e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  35.33 
 
 
622 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.85538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.18 
 
 
774 aa  326  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.89 
 
 
619 aa  315  1e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  31.15 
 
 
647 aa  296  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.65 
 
 
815 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.26 
 
 
777 aa  293  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  42.94 
 
 
365 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
470 aa  219  8e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.34 
 
 
657 aa  186  2e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  29.64 
 
 
656 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.84 
 
 
713 aa  180  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
713 aa  180  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  26.11 
 
 
685 aa  176  1e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 
657 aa  176  1e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  25.39 
 
 
650 aa  175  2e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  38.13 
 
 
272 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.38 
 
 
647 aa  151  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.38 
 
 
647 aa  151  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  26.18 
 
 
680 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  25.76 
 
 
680 aa  142  2e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  39.82 
 
 
253 aa  141  4e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 
657 aa  97.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 
657 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 
655 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  42.57 
 
 
101 aa  78.6  3e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  23.47 
 
 
619 aa  72.4  2e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  5.19212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  21.57 
 
 
444 aa  56.6  1e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  24.92 
 
 
676 aa  57  1e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  23.91 
 
 
650 aa  55.8  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  23.05 
 
 
427 aa  48.9  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 
455 aa  48.9  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  20.18 
 
 
431 aa  48.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  24.23 
 
 
746 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 
441 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 
521 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.95081e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6406  putative amino acid transporter  20.86 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  28.91 
 
 
448 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>