More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0674 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  100 
 
 
415 aa  838    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  63.11 
 
 
413 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  54.89 
 
 
411 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  51.46 
 
 
412 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  51.21 
 
 
412 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  49.28 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  48.66 
 
 
411 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  47.43 
 
 
413 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  48.22 
 
 
432 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 
412 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  47.12 
 
 
412 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  47.37 
 
 
412 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  46.87 
 
 
412 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  46.87 
 
 
412 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  44.2 
 
 
415 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  47.34 
 
 
412 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  47.62 
 
 
412 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  44.98 
 
 
425 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  46.62 
 
 
412 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  46.62 
 
 
412 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  47.34 
 
 
412 aa  358  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  46.98 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  49.75 
 
 
416 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  49.5 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  42.86 
 
 
415 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  44.58 
 
 
416 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  44.58 
 
 
416 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  44.31 
 
 
420 aa  339  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  44.82 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  44.44 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  43.24 
 
 
418 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  43 
 
 
421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  44.91 
 
 
416 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  43.13 
 
 
411 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  42.31 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  42.38 
 
 
423 aa  316  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  41.16 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  43.17 
 
 
414 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  40.88 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 
420 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  39.27 
 
 
419 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.31 
 
 
431 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.88 
 
 
424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  41.09 
 
 
433 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  39.71 
 
 
423 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  35.99 
 
 
420 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  39.66 
 
 
408 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.08 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  38.83 
 
 
430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  41.69 
 
 
419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  38.41 
 
 
417 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.33 
 
 
429 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  40.63 
 
 
424 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  40.25 
 
 
427 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  37.71 
 
 
413 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.42 
 
 
433 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.07 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  39.47 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 
401 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  38.48 
 
 
408 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  38.73 
 
 
408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  36.32 
 
 
414 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 
443 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  36.08 
 
 
414 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  38.07 
 
 
418 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  36.39 
 
 
414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 
414 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.68 
 
 
412 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  35.68 
 
 
413 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  37.38 
 
 
406 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.78 
 
 
429 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.12 
 
 
424 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  37.88 
 
 
408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 
423 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  39.59 
 
 
401 aa  255  9e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  35.42 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  38 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  38.11 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  36.16 
 
 
410 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.47 
 
 
408 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  34.86 
 
 
425 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  35.01 
 
 
425 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  35.01 
 
 
425 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  36.36 
 
 
423 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  36.89 
 
 
418 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  35.25 
 
 
408 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 
424 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  34.77 
 
 
424 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  37.62 
 
 
415 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 
437 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  47.89 
 
 
383 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  34.22 
 
 
424 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  47.89 
 
 
383 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  34.29 
 
 
424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  35.94 
 
 
382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  35.49 
 
 
424 aa  242  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  36.18 
 
 
430 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4098  competence/damage-inducible protein CinA  34.29 
 
 
424 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.83 
 
 
415 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>