71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0670 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
143 aa  289  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  66.67 
 
 
143 aa  189  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  64.08 
 
 
143 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.87 
 
 
143 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  52.82 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  58.16 
 
 
143 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  56.34 
 
 
143 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  58.16 
 
 
143 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  56.03 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.96 
 
 
143 aa  159  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  54.55 
 
 
170 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50 
 
 
143 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  53.57 
 
 
142 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  52.11 
 
 
143 aa  153  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  52.82 
 
 
143 aa  153  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  51.41 
 
 
143 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.82 
 
 
143 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  51.77 
 
 
143 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  50.7 
 
 
143 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  50.7 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
143 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.06 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  50.35 
 
 
142 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.77 
 
 
141 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.37 
 
 
143 aa  140  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  48.59 
 
 
142 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.59 
 
 
141 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.59 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.18 
 
 
142 aa  137  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.89 
 
 
141 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  48.94 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  47.89 
 
 
142 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  48.25 
 
 
143 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.03 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.76 
 
 
143 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.01 
 
 
144 aa  120  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.85 
 
 
143 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  44.03 
 
 
144 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  42.45 
 
 
144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  39.16 
 
 
147 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  111  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  39.16 
 
 
147 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.27 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.58 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  40.41 
 
 
151 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  43.8 
 
 
149 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  42.54 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  41.79 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  40.58 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  37.76 
 
 
147 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.57 
 
 
142 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  36.62 
 
 
142 aa  102  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  38.03 
 
 
142 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  39.53 
 
 
129 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  39.53 
 
 
129 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  38.71 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.52 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  33.1 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  31.43 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  28.57 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  30.84 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  30.84 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  29.91 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.89 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.51 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  29.55 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  27.07 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.47 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>