More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0669 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  74.71 
 
 
433 aa  691  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  72.06 
 
 
436 aa  677  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  71.03 
 
 
432 aa  653  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  70.33 
 
 
432 aa  646  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  70.09 
 
 
432 aa  647  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 
433 aa  890  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  71.59 
 
 
433 aa  667  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  68.22 
 
 
433 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  67.21 
 
 
432 aa  630  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  66.82 
 
 
433 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  67.52 
 
 
433 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  67.52 
 
 
432 aa  611  1e-174  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  65.66 
 
 
439 aa  611  1e-174  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  64.97 
 
 
432 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  64.8 
 
 
441 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  63.13 
 
 
435 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  65.42 
 
 
432 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  64.1 
 
 
434 aa  584  1e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  61.81 
 
 
435 aa  583  1e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  61.63 
 
 
434 aa  581  1e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  61.86 
 
 
434 aa  582  1e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  63.26 
 
 
433 aa  579  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  61.63 
 
 
433 aa  574  1e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  61.72 
 
 
435 aa  572  1e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  60.79 
 
 
434 aa  572  1e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  61.59 
 
 
433 aa  573  1e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  61.48 
 
 
434 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  61.31 
 
 
433 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  63.27 
 
 
423 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  59.12 
 
 
433 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  61.32 
 
 
433 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  59.12 
 
 
433 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  59.3 
 
 
434 aa  554  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  59.12 
 
 
433 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  60.38 
 
 
434 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  60.14 
 
 
435 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  58.43 
 
 
435 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  60.09 
 
 
433 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  57.78 
 
 
434 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  57.91 
 
 
436 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 
431 aa  531  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  57.58 
 
 
433 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.54 
 
 
432 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  59.58 
 
 
433 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  58.75 
 
 
444 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  58.02 
 
 
435 aa  518  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  54.91 
 
 
432 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  55.94 
 
 
433 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  55.48 
 
 
433 aa  511  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  55.97 
 
 
446 aa  506  1e-142  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  55.24 
 
 
433 aa  505  1e-142  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  57.41 
 
 
437 aa  504  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.25462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  54.78 
 
 
433 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  53.74 
 
 
430 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  54.65 
 
 
436 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  55.56 
 
 
434 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  55.04 
 
 
441 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.19 
 
 
444 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  55.87 
 
 
438 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  54.33 
 
 
441 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  57.94 
 
 
432 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  54.8 
 
 
441 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  53.26 
 
 
446 aa  494  1e-138  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.02 
 
 
444 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  52.31 
 
 
439 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  52.55 
 
 
439 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  53.65 
 
 
445 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  52.55 
 
 
434 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 
439 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  53.02 
 
 
444 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  51.63 
 
 
434 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  52.79 
 
 
435 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  52.21 
 
 
428 aa  471  1e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  471  1e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  52.47 
 
 
439 aa  467  1e-130  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  52.21 
 
 
429 aa  467  1e-130  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  54.25 
 
 
433 aa  468  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  51.85 
 
 
432 aa  467  1e-130  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  52.29 
 
 
431 aa  458  1e-128  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
443 aa  461  1e-128  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
441 aa  458  1e-128  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  52.12 
 
 
434 aa  459  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  50.46 
 
 
433 aa  458  1e-128  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.3 
 
 
437 aa  459  1e-128  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 
449 aa  459  1e-128  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  53.63 
 
 
431 aa  459  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 
434 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  52.82 
 
 
439 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
430 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 
444 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  52.59 
 
 
434 aa  453  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  454  1e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  52.33 
 
 
439 aa  454  1e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  52.09 
 
 
439 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  49.31 
 
 
433 aa  454  1e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  51.42 
 
 
436 aa  454  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  52.94 
 
 
448 aa  454  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
429 aa  454  1e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
436 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  52.47 
 
 
439 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>