74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0623 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1241  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.04443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  30.46 
 
 
1140 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  28.6 
 
 
931 aa  138  3e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  27.61 
 
 
2082 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  34.81 
 
 
1030 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  32.83 
 
 
661 aa  95.1  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  41.82 
 
 
3320 aa  77  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.14 
 
 
1567 aa  76.6  1e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.86 
 
 
897 aa  76.3  2e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  30.08 
 
 
256 aa  75.9  2e-12  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31.07 
 
 
336 aa  73.2  1e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.74 
 
 
698 aa  71.6  4e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.77 
 
 
324 aa  71.6  4e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  33.12 
 
 
168 aa  70.9  7e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  34.38 
 
 
446 aa  69.7  2e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  36.88 
 
 
329 aa  69.7  2e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  2.58604e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  24.73 
 
 
516 aa  68.6  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.23 
 
 
597 aa  67.4  7e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  28.74 
 
 
335 aa  65.1  4e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  26.37 
 
 
622 aa  64.7  5e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.2 
 
 
350 aa  64.7  5e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  25.12 
 
 
714 aa  63.9  8e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  25.82 
 
 
386 aa  63.2  1e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.38 
 
 
371 aa  63.2  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.17 
 
 
324 aa  62.8  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.69 
 
 
329 aa  63.2  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  24.91 
 
 
344 aa  62  3e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  28.84 
 
 
315 aa  62  3e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37430  BNR domain-containing protein  30.52 
 
 
418 aa  60.1  1e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  31.22 
 
 
338 aa  59.7  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.81 
 
 
299 aa  58.9  3e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.16 
 
 
369 aa  58.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  26.99 
 
 
332 aa  57.8  6e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  24.13 
 
 
368 aa  56.6  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  25.41 
 
 
323 aa  57  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  30.92 
 
 
214 aa  55.1  4e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  28.64 
 
 
341 aa  55.1  4e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.35 
 
 
325 aa  55.1  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  30.89 
 
 
343 aa  54.7  4e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.33 
 
 
342 aa  54.7  5e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  28.62 
 
 
340 aa  54.7  5e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.57 
 
 
323 aa  51.6  4e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.57 
 
 
323 aa  51.6  4e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  28.29 
 
 
346 aa  52  4e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.4 
 
 
322 aa  51.6  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.4 
 
 
322 aa  51.6  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.4 
 
 
322 aa  51.6  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  24.15 
 
 
363 aa  50.8  8e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  24.72 
 
 
262 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  25.77 
 
 
338 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  25.41 
 
 
356 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  28.06 
 
 
187 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  21.85 
 
 
742 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25.33 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  29.13 
 
 
314 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.92 
 
 
365 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  28.92 
 
 
403 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.29 
 
 
314 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  4.96778e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.43 
 
 
366 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  1.3848e-06 
 
 
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.21 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  30.3 
 
 
324 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  29.17 
 
 
338 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.1 
 
 
334 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.73 
 
 
356 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  28.41 
 
 
338 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  25.42 
 
 
355 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  27.18 
 
 
341 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  28.65 
 
 
3794 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.2 
 
 
359 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  31.15 
 
 
1024 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.87 
 
 
312 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3098e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  24.16 
 
 
361 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  25.48 
 
 
342 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.15 
 
 
323 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>