More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0619 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
228 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  66.82 
 
 
233 aa  308  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  47.98 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  35.79 
 
 
203 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  34.57 
 
 
203 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  34.02 
 
 
203 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  34.04 
 
 
203 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  33.51 
 
 
203 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.51 
 
 
203 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  37.8 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.99 
 
 
203 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.01 
 
 
213 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.47 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
208 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
207 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  36.9 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
214 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  33.82 
 
 
207 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 
204 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
217 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
214 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  32.84 
 
 
207 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
213 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.53 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.53 
 
 
200 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
207 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
200 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
200 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.94 
 
 
200 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
213 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
213 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.21 
 
 
382 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
212 aa  99.4  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
202 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
411 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.17 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
225 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  23.74 
 
 
213 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  32.21 
 
 
160 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
445 aa  93.6  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 
200 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.61 
 
 
442 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
201 aa  92  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
201 aa  92  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.04 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.33 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
459 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
203 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 
226 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.13 
 
 
442 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
245 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.86 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.67 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.77 
 
 
378 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
241 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
212 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
447 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30 
 
 
449 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.95 
 
 
442 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  25 
 
 
198 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>