More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0596 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  57.27 
 
 
234 aa  265  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  53.14 
 
 
236 aa  238  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  45.24 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 
225 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  46.46 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  45.98 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  45.76 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  46.7 
 
 
219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  50.75 
 
 
202 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  47.23 
 
 
230 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  47.58 
 
 
219 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  45.41 
 
 
275 aa  201  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.48 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 
227 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  41.3 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 
230 aa  198  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 
228 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  47.41 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 
231 aa  196  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  41.89 
 
 
247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.48 
 
 
228 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 
244 aa  192  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  41.67 
 
 
231 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 
234 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 
224 aa  191  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 
229 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 
229 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  42.11 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 
228 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  41.92 
 
 
229 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 
234 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 
235 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.4 
 
 
241 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.53 
 
 
241 aa  184  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  39.56 
 
 
276 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  41.78 
 
 
224 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  46.9 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.33 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.33 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  42.61 
 
 
229 aa  181  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  42.92 
 
 
227 aa  181  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  38.98 
 
 
241 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  41.33 
 
 
224 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.03 
 
 
246 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.33 
 
 
224 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.16 
 
 
271 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.39 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.16 
 
 
262 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  42.17 
 
 
229 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 
231 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.45 
 
 
240 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
234 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 
233 aa  174  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 
219 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  39.65 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  43.98 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.48 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.43 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.67 
 
 
271 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.06 
 
 
257 aa  171  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  34.48 
 
 
280 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  40.62 
 
 
225 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  41.71 
 
 
220 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  37.23 
 
 
232 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 
244 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
259 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
233 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 
228 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 
230 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  36.8 
 
 
242 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 
232 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 
219 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  36.52 
 
 
232 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.82 
 
 
237 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  34.05 
 
 
270 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  43.07 
 
 
218 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  34.07 
 
 
229 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 
228 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.7 
 
 
229 aa  165  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.65 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  34.91 
 
 
261 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  34.91 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  35.06 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  40.38 
 
 
224 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.7 
 
 
244 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  42.25 
 
 
240 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 
243 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>