More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0557 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  70.27 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  56.95 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  59.82 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  54.26 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  53.39 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  54.79 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  53.33 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  50.47 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  52.47 
 
 		 226 aa  236  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  50.7 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  50.68 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.6 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  50.7 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.39 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  51.42 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  51.61 
 
 		 247 aa  228  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.69 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.6 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  49.55 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  49.77 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  48.85 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  49.52 
 
 		 253 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  47.71 
 
 		 259 aa  222  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  49.77 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  48.64 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.25 
 
 		 274 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.27 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  48.4 
 
 		 455 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  48.11 
 
 		 255 aa  217  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 257 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  49.53 
 
 		 445 aa  214  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  46.36 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.14 
 
 		 256 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  47.91 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  46.48 
 
 		 252 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 312 aa  211  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  49.52 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.05 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  47.22 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  47.95 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 266 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.13 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.31 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.31 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  43.3 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.34 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  49 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.67 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  46.41 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  47.64 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.36 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  43.18 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  46.05 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  47.69 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.61 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.13 
 
 		 247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  44.2 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  43.38 
 
 		 293 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.66 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  45.7 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.73 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.86 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  43.12 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  45.62 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>