More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0536 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
441 aa  884  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  50.22 
 
 
445 aa  407  1e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.9832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  44.12 
 
 
734 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  41.34 
 
 
415 aa  306  4e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  41.19 
 
 
413 aa  282  8e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 
403 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  41.63 
 
 
735 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  37.27 
 
 
411 aa  274  2e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.1 
 
 
416 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 
411 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  37.86 
 
 
461 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  35.32 
 
 
419 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  35.32 
 
 
419 aa  249  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  36.78 
 
 
399 aa  243  4e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  37.06 
 
 
406 aa  239  7e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 
410 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.35 
 
 
461 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 
470 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 
470 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.52 
 
 
524 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.53 
 
 
534 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.16 
 
 
532 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.72 
 
 
512 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 
533 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 
533 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 
464 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 
471 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  35.29 
 
 
403 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  34.55 
 
 
472 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 
594 aa  223  5e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 
594 aa  223  5e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 
533 aa  221  2e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  37.54 
 
 
533 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.29 
 
 
740 aa  220  4e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37 
 
 
530 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  42.44 
 
 
622 aa  220  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.26 
 
 
535 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 
533 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 
525 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  38.71 
 
 
533 aa  217  3e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.41 
 
 
474 aa  217  3e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.43 
 
 
853 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  33.41 
 
 
489 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.59 
 
 
533 aa  215  1e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 
531 aa  215  1e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.12 
 
 
533 aa  214  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  34.01 
 
 
423 aa  214  2e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 
534 aa  214  2e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.65 
 
 
761 aa  214  2e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.74 
 
 
530 aa  214  3e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.18 
 
 
843 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 
433 aa  212  8e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 
473 aa  213  8e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.2 
 
 
487 aa  212  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.54 
 
 
848 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.34 
 
 
759 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.06 
 
 
531 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.84 
 
 
849 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 
532 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  35.62 
 
 
470 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  33.86 
 
 
503 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.67 
 
 
554 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 
486 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 
515 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 
532 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  34.26 
 
 
533 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 
474 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  35.26 
 
 
534 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 
533 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  36.68 
 
 
748 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  30.25 
 
 
468 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.99 
 
 
856 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  34.04 
 
 
534 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 
526 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.39 
 
 
556 aa  206  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 
532 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  35.22 
 
 
500 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  38.99 
 
 
637 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.01 
 
 
533 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 
532 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.03 
 
 
554 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.62 
 
 
981 aa  203  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  34.65 
 
 
533 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 
554 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 
535 aa  202  1e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.22 
 
 
856 aa  202  1e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 
526 aa  202  1e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.28 
 
 
756 aa  201  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  33.24 
 
 
532 aa  201  2e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  33.1 
 
 
465 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  32.86 
 
 
534 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  38.51 
 
 
538 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 
554 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  38.53 
 
 
619 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  36.97 
 
 
611 aa  199  8e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 
532 aa  199  8e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 
618 aa  199  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  32.63 
 
 
465 aa  199  1e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  40.56 
 
 
638 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  31.69 
 
 
530 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>