More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0495 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  67.93 
 
 		 183 aa  260  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  54.89 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  54.89 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  50.54 
 
 		 184 aa  207  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  203  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  50.54 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  49.46 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  43.72 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  45.25 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.39 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  38.12 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  43.82 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  41.57 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  36.67 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  36.56 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  26.78 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  26.63 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  27.64 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  25.13 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  26.78 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.39 
 
 		 503 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  29.93 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  24.58 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  25.28 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  26.79 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  23.86 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  23.4 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  22.87 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  22.35 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.4 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  26.92 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  27.57 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  23.91 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  30.18 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  26.22 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>