286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0492 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  67.03 
 
 
634 aa  901    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  51.02 
 
 
677 aa  699    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  100 
 
 
634 aa  1299    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  46.95 
 
 
615 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  41.45 
 
 
656 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  43.35 
 
 
610 aa  528  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  40.29 
 
 
665 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  40.29 
 
 
665 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0477  heat shock protein 90  45.61 
 
 
604 aa  522  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.333443  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  41.98 
 
 
629 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  44.36 
 
 
610 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  41.78 
 
 
638 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  40.17 
 
 
669 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  41.92 
 
 
658 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.47 
 
 
652 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  43.59 
 
 
631 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  38.44 
 
 
669 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  39.18 
 
 
603 aa  487  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  40.38 
 
 
611 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  41.92 
 
 
627 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  41.29 
 
 
633 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  38.61 
 
 
636 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  38.09 
 
 
632 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  42.3 
 
 
684 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  38.18 
 
 
634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  37.12 
 
 
634 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  37.25 
 
 
634 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  37.25 
 
 
634 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  37.9 
 
 
634 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  36.84 
 
 
634 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  36.84 
 
 
634 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  36.69 
 
 
634 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  30.05 
 
 
624 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  28.46 
 
 
629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  31.02 
 
 
634 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  31.18 
 
 
634 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  28.01 
 
 
627 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  30.53 
 
 
635 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  31.87 
 
 
634 aa  280  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  31.18 
 
 
634 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  29.4 
 
 
645 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  31.29 
 
 
635 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  31.3 
 
 
642 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  30.17 
 
 
638 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  28.53 
 
 
615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  31.02 
 
 
637 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  29.8 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  31.45 
 
 
634 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  31.02 
 
 
640 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  30.34 
 
 
653 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  29.54 
 
 
613 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  29.81 
 
 
640 aa  271  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  30.2 
 
 
634 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  33.6 
 
 
642 aa  270  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  30.88 
 
 
634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  28.64 
 
 
633 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  30.05 
 
 
650 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  29.79 
 
 
628 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  30.87 
 
 
626 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  30.61 
 
 
634 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  30.28 
 
 
637 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  29.8 
 
 
630 aa  267  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  30.79 
 
 
624 aa  267  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  29.16 
 
 
627 aa  266  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  30.59 
 
 
624 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  30.36 
 
 
623 aa  266  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  26.83 
 
 
628 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  28.77 
 
 
633 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  30.66 
 
 
630 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  30.99 
 
 
624 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  30.99 
 
 
624 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  30.99 
 
 
624 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  30.99 
 
 
624 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  29.29 
 
 
634 aa  264  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  29.8 
 
 
634 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  29.59 
 
 
637 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  30.64 
 
 
629 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  30.14 
 
 
632 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  29.22 
 
 
639 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  29.62 
 
 
638 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  29.59 
 
 
637 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  29.59 
 
 
637 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  30.44 
 
 
630 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  30.52 
 
 
632 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  30.44 
 
 
634 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  28.86 
 
 
645 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  27.99 
 
 
614 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  27.99 
 
 
657 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  29.4 
 
 
652 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  27.68 
 
 
644 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  29.62 
 
 
637 aa  261  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  29.09 
 
 
633 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>