More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0450 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
428 aa  857  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.60258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0998  peptidase RseP  43.76 
 
 
424 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000230134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  36.84 
 
 
430 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.71 
 
 
439 aa  217  3e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  35.23 
 
 
446 aa  213  6e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.56 
 
 
469 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  32.35 
 
 
417 aa  179  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  31.19 
 
 
444 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.81 
 
 
450 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  31.39 
 
 
443 aa  175  1e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  31.01 
 
 
438 aa  175  1e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
450 aa  174  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.27 
 
 
450 aa  175  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  29.05 
 
 
454 aa  174  3e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.36 
 
 
446 aa  174  4e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.4 
 
 
449 aa  172  7e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.64 
 
 
450 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.69 
 
 
454 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  28.35 
 
 
452 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.193e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
456 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  29.15 
 
 
450 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.5 
 
 
450 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  32.69 
 
 
456 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.91 
 
 
466 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  27.39 
 
 
454 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  31.61 
 
 
456 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  30.63 
 
 
452 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  28.63 
 
 
450 aa  167  3e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  29.12 
 
 
507 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  7.40913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.26 
 
 
450 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  29.89 
 
 
452 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  27.91 
 
 
452 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  31.73 
 
 
451 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.1 
 
 
456 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  31.47 
 
 
456 aa  165  1e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  9.71838e-05  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  32.66 
 
 
418 aa  165  1e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.34706e-08  hitchhiker  5.63759e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  31.47 
 
 
456 aa  165  1e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.13842e-05  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.26 
 
 
456 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.47 
 
 
455 aa  164  2e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.96 
 
 
448 aa  165  2e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  27.56 
 
 
463 aa  165  2e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  32 
 
 
451 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.38 
 
 
455 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  29.53 
 
 
454 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.54 
 
 
480 aa  164  4e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.05 
 
 
456 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.2456e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.76 
 
 
456 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  30.46 
 
 
451 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
494 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.03 
 
 
457 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  28.26 
 
 
450 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.23 
 
 
450 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
450 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.23 
 
 
452 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  30.79 
 
 
475 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.98 
 
 
461 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  30.41 
 
 
450 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.45 
 
 
454 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  29.66 
 
 
442 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  27.29 
 
 
469 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.13 
 
 
456 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.25455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  27.65 
 
 
501 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.1 
 
 
451 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  27.65 
 
 
501 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.3 
 
 
456 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  31.58 
 
 
450 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  31.58 
 
 
450 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.58 
 
 
450 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  31.58 
 
 
450 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  31.58 
 
 
450 aa  156  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  30.2 
 
 
451 aa  157  5e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.76 
 
 
456 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  4.61405e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.04 
 
 
452 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  28.11 
 
 
496 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.38 
 
 
495 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.74042e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.51 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  31.03 
 
 
457 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.51 
 
 
462 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.86 
 
 
418 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.68 
 
 
418 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  30.68 
 
 
450 aa  154  3e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  29.68 
 
 
418 aa  154  3e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.04967e-09 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  31.14 
 
 
450 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.11751e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  31.14 
 
 
450 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  30.8 
 
 
450 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  31.14 
 
 
450 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.4207e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  31.14 
 
 
450 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  30.48 
 
 
450 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.11428e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
420 aa  153  6e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.21 
 
 
418 aa  153  6e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.54843e-61 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.79 
 
 
455 aa  153  6e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.68 
 
 
420 aa  153  6e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
420 aa  153  6e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  27.97 
 
 
456 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  29.09 
 
 
438 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.22 
 
 
418 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  28.02 
 
 
417 aa  152  9e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
420 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>