More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0442 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
252 aa  515  1e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.1714e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  78.97 
 
 
252 aa  414  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.28012e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  78.54 
 
 
233 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  4.87185e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  78.54 
 
 
233 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  9.41341e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  74.57 
 
 
232 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  68.65 
 
 
257 aa  371  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.41904e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  71.12 
 
 
232 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.523e-12  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  72.81 
 
 
248 aa  367  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.21925e-08  unclonable  2.22969e-10 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  70.49 
 
 
244 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.85332e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  68.25 
 
 
255 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  4.66794e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  68.65 
 
 
262 aa  364  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  68.25 
 
 
255 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.15088e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  74.89 
 
 
233 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.75862e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  70.8 
 
 
246 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.4456e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  72.29 
 
 
235 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  73.13 
 
 
244 aa  361  5e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.37071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  71.55 
 
 
238 aa  360  9e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.05725e-13  unclonable  1.05333e-08 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  71.62 
 
 
235 aa  358  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.68885e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  72.93 
 
 
233 aa  358  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.30027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  72.93 
 
 
233 aa  358  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.62012e-10  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.72591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.60898e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.868e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  72.1 
 
 
235 aa  357  1e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.51826e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  8.60084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.93043e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  72.49 
 
 
233 aa  357  1e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.91144e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  72.05 
 
 
233 aa  354  7e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.68536e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  70.87 
 
 
236 aa  353  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.83579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  71.3 
 
 
280 aa  348  7e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  68.1 
 
 
262 aa  346  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.93238e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  65.69 
 
 
262 aa  335  4e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.50841e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  67.1 
 
 
267 aa  334  8e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.77478e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  65.52 
 
 
271 aa  333  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.78728e-13  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  67.67 
 
 
255 aa  331  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  65.48 
 
 
255 aa  331  7e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  65.81 
 
 
281 aa  331  7e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.27244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  67.84 
 
 
243 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  66.23 
 
 
257 aa  328  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.16198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  63.92 
 
 
257 aa  327  9e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  64.07 
 
 
260 aa  327  1e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  9.40316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  67.26 
 
 
255 aa  326  2e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  67.26 
 
 
255 aa  325  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  63.64 
 
 
262 aa  325  4e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.19331e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  69.3 
 
 
256 aa  325  4e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  1.52831e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  62.55 
 
 
259 aa  325  5e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  3.41164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  65.93 
 
 
251 aa  324  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.02151e-13  hitchhiker  3.84341e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  65.24 
 
 
274 aa  322  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  67.97 
 
 
258 aa  322  5e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  67.7 
 
 
251 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  63.88 
 
 
257 aa  321  6e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  63.91 
 
 
256 aa  321  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.26335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  60.73 
 
 
301 aa  319  2e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  1.23477e-06  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  64.86 
 
 
343 aa  313  2e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  64.86 
 
 
314 aa  312  3e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  65.32 
 
 
315 aa  312  3e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 
304 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.36253e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  62.71 
 
 
260 aa  310  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.99149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  65 
 
 
301 aa  309  3e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  60.79 
 
 
288 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  60.16 
 
 
289 aa  304  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  61.43 
 
 
291 aa  304  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.18359e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  62.05 
 
 
300 aa  298  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  61.06 
 
 
287 aa  298  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  58.54 
 
 
257 aa  298  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0080  ribosomal protein S2  58.5 
 
 
263 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.55744e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  60.71 
 
 
316 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4236  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 
260 aa  294  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47656e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  55.64 
 
 
282 aa  294  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  55.56 
 
 
264 aa  294  9e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  60.71 
 
 
289 aa  293  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 
284 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 
284 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 
284 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  59.73 
 
 
273 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  55.16 
 
 
279 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  54.44 
 
 
262 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  58.37 
 
 
255 aa  292  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  62.78 
 
 
250 aa  291  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  5.8431e-05  unclonable  1.92008e-09 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1161  30S ribosomal protein S2  56.58 
 
 
272 aa  291  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  58.22 
 
 
246 aa  291  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.59372e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  60.18 
 
 
272 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  55.14 
 
 
251 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3113  ribosomal protein S2  59.38 
 
 
296 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.18709e-05  normal  0.0242876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5911  ribosomal protein S2  58.48 
 
 
304 aa  287  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  56.35 
 
 
294 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.45501e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2061  30S ribosomal protein S2  55.26 
 
 
265 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.4963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1322  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 
295 aa  285  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2507  ribosomal protein S2  55.74 
 
 
353 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282743  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1230  30S ribosomal protein S2  57.78 
 
 
279 aa  285  6e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133873  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  59.64 
 
 
283 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  52.76 
 
 
262 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  59.19 
 
 
303 aa  284  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09890  SSU ribosomal protein S2P  60.09 
 
 
278 aa  284  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  54.51 
 
 
245 aa  284  9e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.06427e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  58.67 
 
 
283 aa  284  1e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  59.82 
 
 
254 aa  283  1e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  54.51 
 
 
245 aa  283  1e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  2.47942e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>