147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0428 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 930 aa  1895    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  57.91 
 
 		 755 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.24 
 
 		 505 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  38.15 
 
 		 505 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.55 
 
 		 466 aa  211  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.91 
 
 		 748 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 		 462 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 		 709 aa  198  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 459 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  34.23 
 
 		 426 aa  194  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  36.6 
 
 		 346 aa  194  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  35.6 
 
 		 347 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  39.93 
 
 		 630 aa  189  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  42.04 
 
 		 426 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  34.66 
 
 		 1302 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  37.94 
 
 		 638 aa  181  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  40.98 
 
 		 451 aa  181  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  36.27 
 
 		 322 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  33.45 
 
 		 610 aa  160  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  35.02 
 
 		 457 aa  150  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1167 aa  148  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.94 
 
 		 631 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  40 
 
 		 2286 aa  135  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.52 
 
 		 6885 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  36.75 
 
 		 547 aa  118  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  34.91 
 
 		 729 aa  105  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  29.61 
 
 		 1221 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32 
 
 		 717 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24.24 
 
 		 626 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  31.32 
 
 		 3320 aa  88.2  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.33 
 
 		 1042 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.56 
 
 		 1661 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  31.33 
 
 		 1729 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  27.18 
 
 		 651 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1457 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  29.48 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.74 
 
 		 2073 aa  84.7  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.46 
 
 		 1004 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  32.97 
 
 		 779 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  29.34 
 
 		 2375 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  34.27 
 
 		 1050 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.74 
 
 		 1013 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 1016 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.71 
 
 		 1495 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  24.76 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  27.84 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  24.7 
 
 		 1174 aa  67  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  28.77 
 
 		 618 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.3 
 
 		 1194 aa  66.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  26.35 
 
 		 1009 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  31.58 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  21.97 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  27.44 
 
 		 2207 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30.99 
 
 		 1421 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  25.95 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 1321 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.12 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  28.14 
 
 		 2178 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.32 
 
 		 932 aa  60.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  25.08 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  26.95 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  21.47 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.76 
 
 		 1847 aa  58.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  30.99 
 
 		 926 aa  57.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.75 
 
 		 1029 aa  56.6  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.07 
 
 		 526 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  26.06 
 
 		 223 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  27.97 
 
 		 627 aa  55.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  28.1 
 
 		 524 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  24.9 
 
 		 453 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  26.22 
 
 		 920 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  27.03 
 
 		 523 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  21.84 
 
 		 566 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  26.01 
 
 		 935 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  27.27 
 
 		 880 aa  53.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  26.58 
 
 		 768 aa  52.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  31.78 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  31.78 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  29.37 
 
 		 620 aa  52  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.63 
 
 		 596 aa  51.2  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  28.48 
 
 		 531 aa  51.2  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  28.57 
 
 		 620 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  30.84 
 
 		 697 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.95 
 
 		 1821 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 		 620 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.27 
 
 		 335 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.19 
 
 		 1054 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  22.56 
 
 		 754 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  24.85 
 
 		 921 aa  50.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  26.35 
 
 		 518 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  22.42 
 
 		 1081 aa  50.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  26.73 
 
 		 478 aa  50.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  28.64 
 
 		 615 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  25.53 
 
 		 413 aa  49.3  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  29.17 
 
 		 220 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  23.95 
 
 		 548 aa  48.9  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  36 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  24.4 
 
 		 693 aa  48.9  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 567 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>