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for query gene Ccel_0411 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 531 aa  1052    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.57 
 
 		 565 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 592 aa  343  5.999999999999999e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 		 541 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  35.89 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 561 aa  329  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 682 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 682 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  35.11 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  34.93 
 
 		 537 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 522 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 538 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 537 aa  320  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
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NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 		 525 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  34.91 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  34.91 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 528 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 538 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 		 676 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 		 697 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 650 aa  309  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 607 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 678 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.84 
 
 		 666 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 535 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 685 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 		 554 aa  300  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 569 aa  299  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  36.48 
 
 		 476 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 539 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.27 
 
 		 1062 aa  296  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.75 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 555 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 685 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 593 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 621 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
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NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 672 aa  286  5e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 		 509 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 504 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 		 504 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  36.56 
 
 		 666 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 526 aa  279  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.24 
 
 		 520 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 		 1102 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 505 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 890 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.47 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 641 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 539 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 567 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 684 aa  273  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 504 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 504 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  32.03 
 
 		 507 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 702 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  31.84 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 519 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 		 511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  34.91 
 
 		 511 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.93 
 
 		 511 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 		 500 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.91 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
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NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 495 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  34.7 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 615 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 495 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 550 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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