More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0374 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  100 
 
 		 450 aa  929    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  42.98 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  44.81 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  42.86 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  43.89 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  43.05 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  43.64 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  40.62 
 
 		 486 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  39.32 
 
 		 478 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  42.49 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  43.02 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  40.13 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  38.85 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  41.89 
 
 		 448 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  41.45 
 
 		 471 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  41.44 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  40.86 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  39.52 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  42.06 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  42.07 
 
 		 451 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  41.14 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  40.94 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  41.77 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  41.93 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  39.04 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  41.45 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  41.23 
 
 		 453 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  42.16 
 
 		 447 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  42.12 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  40.63 
 
 		 484 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.76 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  39.71 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  39.83 
 
 		 482 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  40.09 
 
 		 474 aa  326  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  41.74 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  40.76 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  40.53 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  38.57 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  41.76 
 
 		 453 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  39.53 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  40.82 
 
 		 447 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  40.27 
 
 		 440 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  42.54 
 
 		 465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.82 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  38.87 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  41.21 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.85 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  39.44 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  38.14 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  39.7 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  39.78 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  43.22 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  40.22 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  40 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  38.25 
 
 		 500 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  39.04 
 
 		 470 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  40.18 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  39.78 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  40 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  38.83 
 
 		 909 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  39.51 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  39.65 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  39.53 
 
 		 482 aa  309  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  38.45 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  39.17 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  38.27 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  38.76 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  40.13 
 
 		 443 aa  305  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  39.16 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  38.08 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  39.73 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  38.78 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  39.86 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  38.74 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  37.53 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  38.57 
 
 		 471 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  38.53 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  37.76 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  38.67 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  40.5 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  39.64 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.63 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  37.3 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  36.88 
 
 		 491 aa  299  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  38.11 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  38.53 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  38.13 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.97 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  37.5 
 
 		 517 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  40.43 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  37.42 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  37.75 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  36.49 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  37.75 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  38.55 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  38 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  38.19 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  36.53 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  37.53 
 
 		 451 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>