53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0369 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.0387e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  56.84 
 
 
98 aa  118  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.24096e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  48.48 
 
 
106 aa  109  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.1297e-14  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  54.35 
 
 
116 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  7.60928e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  53.85 
 
 
96 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.41625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  53.26 
 
 
97 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  54.35 
 
 
95 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  53.61 
 
 
101 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.97055e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  53.26 
 
 
116 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  9.85967e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  51.55 
 
 
105 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  54.35 
 
 
96 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.25985e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  50.54 
 
 
99 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.49551e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  51.04 
 
 
102 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.66653e-10  decreased coverage  5.85819e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  44.79 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  48.94 
 
 
98 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  4.48055e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  37.23 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  40.18 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  1.28985e-07  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2436  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.81987e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.89247e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  40.21 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  34.75 
 
 
130 aa  79.3  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  6.19685e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  76.6  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0467  hypothetical protein  64.71 
 
 
77 aa  74.7  4e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.82221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2926  hypothetical protein  61.22 
 
 
52 aa  68.2  4e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2057  hypothetical protein  58 
 
 
67 aa  67.4  6e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.32922  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0747  hypothetical protein  57.14 
 
 
51 aa  66.2  1e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0273409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0762  hypothetical protein  57.14 
 
 
51 aa  66.2  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.92428e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0078  hypothetical protein  49.21 
 
 
68 aa  65.9  2e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.80908e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
189 aa  65.9  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.22537e-08  unclonable  6.59676e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
189 aa  64.3  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000124121  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0613  hypothetical protein  64.29 
 
 
51 aa  63.5  9e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0627  hypothetical protein  64.29 
 
 
51 aa  63.5  9e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.236913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1432  hypothetical protein  59.57 
 
 
58 aa  60.8  6e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.205478  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32335  predicted protein  58.54 
 
 
234 aa  59.7  1e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00362382  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1068  hypothetical protein  58.14 
 
 
51 aa  57.8  5e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.82951e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1256  hypothetical protein  58.14 
 
 
51 aa  57.8  5e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.9657e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2664  hypothetical protein  54.76 
 
 
62 aa  53.5  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2538  hypothetical protein  45 
 
 
67 aa  50.4  8e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0131849  normal  0.465998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2535  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  46.34 
 
 
73 aa  48.9  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0399003  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2096  hypothetical protein  42.31 
 
 
64 aa  48.5  3e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.730505  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0298  hypothetical protein  37.93 
 
 
102 aa  48.1  4e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0150675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2161  hypothetical protein  39.13 
 
 
63 aa  47.4  6e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158073  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2351  hypothetical protein  36.96 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00738797  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0345  hypothetical protein  48.65 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2367  hypothetical protein  36.96 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00270625  normal  0.0564392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2536  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  41.46 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0734  hypothetical protein  45.45 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.55794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2365  DNA-directed RNA polymerase I, II, and III, 7.3 kDa polypeptide  43.59 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224904  normal  0.052764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>