150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0340 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 158 aa  218  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  58.67 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  59.57 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  53.8 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  56.16 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  59.86 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  47.13 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  45.57 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  45.86 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  46.15 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  46.15 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  45.22 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  43.95 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  43.31 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  44.59 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  42.95 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  41.03 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  41.67 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  42.95 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  42.31 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  40.38 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  46.3 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  40.25 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  48.57 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  40.13 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  41.4 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  40.13 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  43.88 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  43.59 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  41.67 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  39.49 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  43.33 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  43.33 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  47.26 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  42.67 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  45.1 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  42 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  42 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  42 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  38.96 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 148 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  40.4 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  40.4 
 
 		 197 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  39.49 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  39.49 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  40.54 
 
 		 174 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  36.31 
 
 		 208 aa  111  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  32.39 
 
 		 171 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 		 174 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  33.74 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  30.38 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  29.33 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 172 aa  87  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2613  transcriptional regulator, CarD family  30.07 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>