More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0328 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 468 aa  966    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 518 aa  186  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 464 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 474 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 447 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.54 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 476 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.67 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  38.56 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  43.12 
 
 		 728 aa  99.8  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 430 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 492 aa  96.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 476 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.59 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  32.68 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  38.03 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  28.39 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 507 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.6 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  29.12 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 281 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  31.89 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  30.32 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  30.32 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  22.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  22.41 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  21.68 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>