More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0308 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  84.89 
 
 		 141 aa  250  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  79.14 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  77.86 
 
 		 140 aa  223  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  74.1 
 
 		 141 aa  217  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  76.26 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 		 141 aa  217  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  74.47 
 
 		 142 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  73.05 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  72.66 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 141 aa  208  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  72.66 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  203  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  203  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3693  ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000590781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  199  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  196  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  66.43 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  71.97 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 143 aa  190  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  68.7 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>