More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0283 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 376 aa  770    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  64.08 
 
 		 376 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  51.75 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  52.72 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  50.27 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  50.69 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  51.76 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  48.68 
 
 		 383 aa  359  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  49.18 
 
 		 371 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  46.38 
 
 		 365 aa  348  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  48.1 
 
 		 393 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  50.96 
 
 		 353 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  48.11 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  48.24 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  48.78 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  47.63 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  46.54 
 
 		 362 aa  328  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  46.4 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  46.28 
 
 		 361 aa  325  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  46.28 
 
 		 362 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  46.4 
 
 		 361 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  45.77 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  48.92 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  46.67 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  46.67 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  46.28 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  46.98 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  46.49 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  46.28 
 
 		 361 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  47.81 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  47.83 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  46.76 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  45.6 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  46.17 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  45.53 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  45.53 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  44.99 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  47.58 
 
 		 352 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  45.58 
 
 		 351 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  45.75 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  44.51 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 364 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  46.3 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  44.5 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  47.27 
 
 		 351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  44.86 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  46.01 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  45.48 
 
 		 353 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  45.53 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  46.07 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  44.65 
 
 		 369 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  45.41 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  43.73 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  43.12 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  42.06 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  46.09 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  44.39 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  44.62 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  41.24 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.17 
 
 		 369 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  44.5 
 
 		 363 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  42.42 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  43.01 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  42.67 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  44.95 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  42.67 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  43.24 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  42.67 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  42.33 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.27 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  42.93 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  43.24 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  43.51 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  42.06 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  41.48 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  42.15 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  43.46 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  41.94 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  42.93 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 355 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  42.29 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  41.78 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  42.51 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  42.01 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  42.23 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  41.02 
 
 		 348 aa  272  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>