More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0272 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
484 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
473 aa  670    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
468 aa  671    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
464 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
470 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
517 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
470 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 
468 aa  634    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
462 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
470 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.83 
 
 
468 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 
468 aa  634    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.35 
 
 
509 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.86 
 
 
521 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 
476 aa  648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
471 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.32 
 
 
469 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.32 
 
 
469 aa  674    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.86 
 
 
521 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.32 
 
 
469 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 
473 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
482 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  68.53 
 
 
547 aa  645    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
484 aa  634    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
464 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.83 
 
 
465 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.44 
 
 
471 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 
474 aa  653    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 
476 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 
482 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  68.61 
 
 
467 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.45 
 
 
464 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  66.95 
 
 
468 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
468 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
468 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
464 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.76 
 
 
482 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
473 aa  671    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
462 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.83 
 
 
468 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 
470 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  67.23 
 
 
501 aa  638    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
465 aa  941    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.32 
 
 
469 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
470 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
472 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
471 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
471 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  69.43 
 
 
470 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.04 
 
 
462 aa  741    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  72.14 
 
 
487 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  68.01 
 
 
482 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
475 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
470 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.76 
 
 
467 aa  739    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
467 aa  638    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
475 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.93 
 
 
472 aa  700    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
459 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
462 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
462 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
470 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
481 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
475 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
474 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.79 
 
 
478 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
503 aa  649    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.53 
 
 
464 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 
461 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
519 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.41 
 
 
465 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.41 
 
 
465 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.83 
 
 
457 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 
462 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.44 
 
 
476 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
470 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
470 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.79 
 
 
476 aa  668    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.46 
 
 
469 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
464 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
472 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.1 
 
 
469 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  70.41 
 
 
464 aa  654    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  67.6 
 
 
471 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
468 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
484 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
464 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  72.79 
 
 
465 aa  676    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.64 
 
 
474 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
481 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.04 
 
 
458 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>