More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0243 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  226  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  75.65 
 
 
113 aa  184  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  58.26 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  57.39 
 
 
111 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  59.13 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  59.13 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  57.39 
 
 
108 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  58.1 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  56.86 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  60 
 
 
105 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  56.86 
 
 
102 aa  120  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  54.46 
 
 
102 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  52.17 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  53.54 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  51.49 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  49.57 
 
 
112 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  55.1 
 
 
104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  54.46 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  50.5 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  54.46 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  51.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  51 
 
 
99 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  48.04 
 
 
102 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  57.14 
 
 
104 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  51.49 
 
 
104 aa  103  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  59.79 
 
 
110 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  58.82 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  58.82 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  45.1 
 
 
102 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  47 
 
 
101 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  56.12 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  48.98 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  54.12 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  45.63 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  46.88 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  48.51 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  54.76 
 
 
108 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  49.47 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  44.35 
 
 
116 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  53.57 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  45.54 
 
 
110 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  45.54 
 
 
110 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  45.54 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  51.19 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  51.81 
 
 
109 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  53.09 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  41.58 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46.32 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  45.36 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  40.38 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  44 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  45 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  41.58 
 
 
110 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  42.57 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  40.95 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  40.59 
 
 
104 aa  84  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  40.2 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  45.36 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40.59 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.59 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  38.68 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  40.95 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  40.78 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  39.22 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.6 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  41.58 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  40.21 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  40.38 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  40.38 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  44.9 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  47.56 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  34.31 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.95 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  34.31 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>