More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0178 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 596 aa  1204    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  58 
 
 		 582 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  44.28 
 
 		 597 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  44.28 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  52.62 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  50.24 
 
 		 422 aa  364  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  50.24 
 
 		 414 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.25 
 
 		 441 aa  357  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  42.37 
 
 		 569 aa  355  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  50.24 
 
 		 420 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  49.75 
 
 		 421 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0203  GTP-binding protein, HSR1-related  44.04 
 
 		 608 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0218  GTP-binding protein HSR1-related  43.58 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116932  normal  0.0905188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3183  small GTP-binding protein  41.81 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  39.38 
 
 		 561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  48.03 
 
 		 493 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  40.61 
 
 		 553 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  49.49 
 
 		 395 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  47.03 
 
 		 503 aa  336  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.63 
 
 		 502 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  39.32 
 
 		 564 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  39.32 
 
 		 564 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1687  GTP-binding proten HflX  41.98 
 
 		 560 aa  330  6e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  42.74 
 
 		 521 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  39.04 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  39.71 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  46.62 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2043  GTP-binding protein  44.23 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  44.69 
 
 		 509 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2258  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 442 aa  323  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0005  GTP-binding protein HSR1-related  39.53 
 
 		 565 aa  323  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  38.27 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.77 
 
 		 441 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  43.04 
 
 		 509 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  42.5 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.99 
 
 		 486 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.67 
 
 		 419 aa  316  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  44.65 
 
 		 512 aa  316  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43.98 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  44.47 
 
 		 512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  43.42 
 
 		 419 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2557  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.19 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804592  hitchhiker  0.00000575237 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.19 
 
 		 436 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 419 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  43.15 
 
 		 482 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  46.15 
 
 		 515 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  46.49 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  43.18 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  40.22 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2815  GTP-binding proten HflX  40.18 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  42.93 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 512 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  42.93 
 
 		 419 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  42.93 
 
 		 419 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  42.93 
 
 		 419 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  43.98 
 
 		 429 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2913  GTP-binding proten HflX  42.11 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.06 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  43.49 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.49 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.68 
 
 		 419 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1395  GTP-binding proten HflX  40.93 
 
 		 557 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0812347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  46.15 
 
 		 524 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5344  GTP-binding proten HflX  40.79 
 
 		 563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0376  GTP-binding protein HflX  41.25 
 
 		 490 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2895  small GTP-binding protein  40.41 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  44.93 
 
 		 493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  41.3 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  44.05 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  40.45 
 
 		 461 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  42.54 
 
 		 433 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  42.4 
 
 		 435 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0905  small GTP-binding protein  39.25 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  44.25 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  43.02 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1947  GTP-binding proten HflX  38.13 
 
 		 655 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  42.25 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  42.96 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  42.39 
 
 		 522 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1009  GTP-binding protein  41.53 
 
 		 555 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  42.28 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  43.19 
 
 		 421 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.61 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  36.54 
 
 		 583 aa  299  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.61 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  45.52 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  40.66 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  40.66 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  40.66 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.17 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  40.66 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>